Protein–RNA interactions for Protein: Q99578

RIT2, GTP-binding protein Rit2, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIT2Q99578 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC38.76■■■■□ 3.8
RIT2Q99578 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
RIT2Q99578 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
RIT2Q99578 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
RIT2Q99578 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC37.57■■■■□ 3.6
RIT2Q99578 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
RIT2Q99578 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC37.44■■■■□ 3.58
RIT2Q99578 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.5
RIT2Q99578 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.71■■■■□ 3.47
RIT2Q99578 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
RIT2Q99578 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
RIT2Q99578 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
RIT2Q99578 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
RIT2Q99578 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
RIT2Q99578 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
RIT2Q99578 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
RIT2Q99578 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
RIT2Q99578 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
RIT2Q99578 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
RIT2Q99578 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
RIT2Q99578 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
RIT2Q99578 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
RIT2Q99578 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
RIT2Q99578 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
RIT2Q99578 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
RIT2Q99578 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
RIT2Q99578 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
RIT2Q99578 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
RIT2Q99578 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
RIT2Q99578 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
RIT2Q99578 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
RIT2Q99578 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
RIT2Q99578 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
RIT2Q99578 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
RIT2Q99578 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
RIT2Q99578 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
RIT2Q99578 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
RIT2Q99578 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
RIT2Q99578 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
RIT2Q99578 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
RIT2Q99578 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
RIT2Q99578 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
RIT2Q99578 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
RIT2Q99578 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
RIT2Q99578 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.23■■■■□ 3.07
RIT2Q99578 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
RIT2Q99578 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
RIT2Q99578 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
RIT2Q99578 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RIT2Q99578 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RIT2Q99578 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RIT2Q99578 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RIT2Q99578 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RIT2Q99578 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
RIT2Q99578 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
RIT2Q99578 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
RIT2Q99578 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
RIT2Q99578 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
RIT2Q99578 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
RIT2Q99578 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
RIT2Q99578 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
RIT2Q99578 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
RIT2Q99578 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
RIT2Q99578 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
RIT2Q99578 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
RIT2Q99578 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.94
RIT2Q99578 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
RIT2Q99578 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
RIT2Q99578 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
RIT2Q99578 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
RIT2Q99578 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
RIT2Q99578 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
RIT2Q99578 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
RIT2Q99578 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
RIT2Q99578 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
RIT2Q99578 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
RIT2Q99578 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
RIT2Q99578 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
RIT2Q99578 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
RIT2Q99578 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
RIT2Q99578 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
RIT2Q99578 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
RIT2Q99578 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
RIT2Q99578 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
RIT2Q99578 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
RIT2Q99578 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
RIT2Q99578 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
RIT2Q99578 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
RIT2Q99578 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
RIT2Q99578 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
RIT2Q99578 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
RIT2Q99578 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
RIT2Q99578 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
RIT2Q99578 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
RIT2Q99578 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
RIT2Q99578 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
RIT2Q99578 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
RIT2Q99578 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
RIT2Q99578 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
RIT2Q99578 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms