Protein–RNA interactions for Protein: Q96S82

UBL7, Ubiquitin-like protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL7Q96S82 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
UBL7Q96S82 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
UBL7Q96S82 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.84■■■□□ 2.69
UBL7Q96S82 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
UBL7Q96S82 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
UBL7Q96S82 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
UBL7Q96S82 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
UBL7Q96S82 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
UBL7Q96S82 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
UBL7Q96S82 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
UBL7Q96S82 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
UBL7Q96S82 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
UBL7Q96S82 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
UBL7Q96S82 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
UBL7Q96S82 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
UBL7Q96S82 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
UBL7Q96S82 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
UBL7Q96S82 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
UBL7Q96S82 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
UBL7Q96S82 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
UBL7Q96S82 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
UBL7Q96S82 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
UBL7Q96S82 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
UBL7Q96S82 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
UBL7Q96S82 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
UBL7Q96S82 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
UBL7Q96S82 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
UBL7Q96S82 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
UBL7Q96S82 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
UBL7Q96S82 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
UBL7Q96S82 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
UBL7Q96S82 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
UBL7Q96S82 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
UBL7Q96S82 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
UBL7Q96S82 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
UBL7Q96S82 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
UBL7Q96S82 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
UBL7Q96S82 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
UBL7Q96S82 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
UBL7Q96S82 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
UBL7Q96S82 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
UBL7Q96S82 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
UBL7Q96S82 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
UBL7Q96S82 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
UBL7Q96S82 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
UBL7Q96S82 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
UBL7Q96S82 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
UBL7Q96S82 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
UBL7Q96S82 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
UBL7Q96S82 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
UBL7Q96S82 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
UBL7Q96S82 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
UBL7Q96S82 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
UBL7Q96S82 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
UBL7Q96S82 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
UBL7Q96S82 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
UBL7Q96S82 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
UBL7Q96S82 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
UBL7Q96S82 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
UBL7Q96S82 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
UBL7Q96S82 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
UBL7Q96S82 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
UBL7Q96S82 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
UBL7Q96S82 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
UBL7Q96S82 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
UBL7Q96S82 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
UBL7Q96S82 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
UBL7Q96S82 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
UBL7Q96S82 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
UBL7Q96S82 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
UBL7Q96S82 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
UBL7Q96S82 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
UBL7Q96S82 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
UBL7Q96S82 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
UBL7Q96S82 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
UBL7Q96S82 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
UBL7Q96S82 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
UBL7Q96S82 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
UBL7Q96S82 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
UBL7Q96S82 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
UBL7Q96S82 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
UBL7Q96S82 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBL7Q96S82 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBL7Q96S82 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBL7Q96S82 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBL7Q96S82 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBL7Q96S82 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBL7Q96S82 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBL7Q96S82 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBL7Q96S82 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBL7Q96S82 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBL7Q96S82 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBL7Q96S82 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
UBL7Q96S82 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
UBL7Q96S82 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
UBL7Q96S82 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
UBL7Q96S82 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
UBL7Q96S82 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
UBL7Q96S82 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
UBL7Q96S82 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms