Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PRAC1Q96KF2 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRAC1Q96KF2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRAC1Q96KF2 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRAC1Q96KF2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRAC1Q96KF2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRAC1Q96KF2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRAC1Q96KF2 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAC1Q96KF2 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRAC1Q96KF2 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PRAC1Q96KF2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAC1Q96KF2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAC1Q96KF2 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRAC1Q96KF2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRAC1Q96KF2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAC1Q96KF2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAC1Q96KF2 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAC1Q96KF2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAC1Q96KF2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PRAC1Q96KF2 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAC1Q96KF2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAC1Q96KF2 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRAC1Q96KF2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAC1Q96KF2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRAC1Q96KF2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAC1Q96KF2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRAC1Q96KF2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAC1Q96KF2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAC1Q96KF2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAC1Q96KF2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAC1Q96KF2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAC1Q96KF2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAC1Q96KF2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRAC1Q96KF2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRAC1Q96KF2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRAC1Q96KF2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRAC1Q96KF2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PRAC1Q96KF2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PRAC1Q96KF2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRAC1Q96KF2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRAC1Q96KF2 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAC1Q96KF2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAC1Q96KF2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAC1Q96KF2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAC1Q96KF2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PRAC1Q96KF2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRAC1Q96KF2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRAC1Q96KF2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRAC1Q96KF2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRAC1Q96KF2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRAC1Q96KF2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRAC1Q96KF2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRAC1Q96KF2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRAC1Q96KF2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PRAC1Q96KF2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRAC1Q96KF2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRAC1Q96KF2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRAC1Q96KF2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PRAC1Q96KF2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRAC1Q96KF2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRAC1Q96KF2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PRAC1Q96KF2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAC1Q96KF2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRAC1Q96KF2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRAC1Q96KF2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAC1Q96KF2 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAC1Q96KF2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRAC1Q96KF2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRAC1Q96KF2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRAC1Q96KF2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRAC1Q96KF2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRAC1Q96KF2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRAC1Q96KF2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAC1Q96KF2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRAC1Q96KF2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRAC1Q96KF2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRAC1Q96KF2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRAC1Q96KF2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRAC1Q96KF2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRAC1Q96KF2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRAC1Q96KF2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PRAC1Q96KF2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRAC1Q96KF2 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRAC1Q96KF2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRAC1Q96KF2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PRAC1Q96KF2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRAC1Q96KF2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRAC1Q96KF2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAC1Q96KF2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAC1Q96KF2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAC1Q96KF2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAC1Q96KF2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRAC1Q96KF2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAC1Q96KF2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PRAC1Q96KF2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRAC1Q96KF2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PRAC1Q96KF2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRAC1Q96KF2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PRAC1Q96KF2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PRAC1Q96KF2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms