Protein–RNA interactions for Protein: Q96GN5

CDCA7L, Cell division cycle-associated 7-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA7LQ96GN5 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC44.41■■■■■ 4.7
CDCA7LQ96GN5 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
CDCA7LQ96GN5 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC43.56■■■■■ 4.56
CDCA7LQ96GN5 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.38■■■■■ 4.54
CDCA7LQ96GN5 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC43.11■■■■■ 4.49
CDCA7LQ96GN5 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC43.1■■■■■ 4.49
CDCA7LQ96GN5 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
CDCA7LQ96GN5 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC42.87■■■■■ 4.45
CDCA7LQ96GN5 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
CDCA7LQ96GN5 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC42.36■■■■■ 4.37
CDCA7LQ96GN5 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC42.34■■■■■ 4.37
CDCA7LQ96GN5 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
CDCA7LQ96GN5 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC41.96■■■■■ 4.31
CDCA7LQ96GN5 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
CDCA7LQ96GN5 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.46■■■■■ 4.23
CDCA7LQ96GN5 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
CDCA7LQ96GN5 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.32■■■■■ 4.21
CDCA7LQ96GN5 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC41.24■■■■■ 4.19
CDCA7LQ96GN5 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
CDCA7LQ96GN5 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.09■■■■■ 4.17
CDCA7LQ96GN5 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.97■■■■■ 4.15
CDCA7LQ96GN5 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC40.93■■■■■ 4.14
CDCA7LQ96GN5 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
CDCA7LQ96GN5 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.77■■■■■ 4.12
CDCA7LQ96GN5 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
CDCA7LQ96GN5 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
CDCA7LQ96GN5 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
CDCA7LQ96GN5 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC40.58■■■■■ 4.09
CDCA7LQ96GN5 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC40.57■■■■■ 4.09
CDCA7LQ96GN5 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.48■■■■■ 4.07
CDCA7LQ96GN5 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
CDCA7LQ96GN5 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.35■■■■■ 4.05
CDCA7LQ96GN5 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.34■■■■■ 4.05
CDCA7LQ96GN5 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
CDCA7LQ96GN5 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
CDCA7LQ96GN5 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
CDCA7LQ96GN5 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC40.05■■■■■ 4
CDCA7LQ96GN5 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC40.02■■■■■ 4
CDCA7LQ96GN5 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
CDCA7LQ96GN5 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.95■■■■□ 3.99
CDCA7LQ96GN5 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC39.76■■■■□ 3.96
CDCA7LQ96GN5 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
CDCA7LQ96GN5 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC39.68■■■■□ 3.94
CDCA7LQ96GN5 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
CDCA7LQ96GN5 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC39.56■■■■□ 3.92
CDCA7LQ96GN5 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.43■■■■□ 3.9
CDCA7LQ96GN5 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
CDCA7LQ96GN5 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC39.32■■■■□ 3.89
CDCA7LQ96GN5 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
CDCA7LQ96GN5 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
CDCA7LQ96GN5 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
CDCA7LQ96GN5 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
CDCA7LQ96GN5 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
CDCA7LQ96GN5 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
CDCA7LQ96GN5 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
CDCA7LQ96GN5 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
CDCA7LQ96GN5 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC39.06■■■■□ 3.84
CDCA7LQ96GN5 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
CDCA7LQ96GN5 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
CDCA7LQ96GN5 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
CDCA7LQ96GN5 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC38.93■■■■□ 3.82
CDCA7LQ96GN5 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
CDCA7LQ96GN5 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.85■■■■□ 3.81
CDCA7LQ96GN5 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
CDCA7LQ96GN5 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC38.83■■■■□ 3.81
CDCA7LQ96GN5 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
CDCA7LQ96GN5 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
CDCA7LQ96GN5 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
CDCA7LQ96GN5 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
CDCA7LQ96GN5 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
CDCA7LQ96GN5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC38.62■■■■□ 3.77
CDCA7LQ96GN5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
CDCA7LQ96GN5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
CDCA7LQ96GN5 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
CDCA7LQ96GN5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
CDCA7LQ96GN5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
CDCA7LQ96GN5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
CDCA7LQ96GN5 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
CDCA7LQ96GN5 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
CDCA7LQ96GN5 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
CDCA7LQ96GN5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
CDCA7LQ96GN5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC38.29■■■■□ 3.72
CDCA7LQ96GN5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
CDCA7LQ96GN5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
CDCA7LQ96GN5 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
CDCA7LQ96GN5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
CDCA7LQ96GN5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
CDCA7LQ96GN5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
CDCA7LQ96GN5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
CDCA7LQ96GN5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC38.1■■■■□ 3.69
CDCA7LQ96GN5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
CDCA7LQ96GN5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
CDCA7LQ96GN5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC38.02■■■■□ 3.68
CDCA7LQ96GN5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
CDCA7LQ96GN5 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
CDCA7LQ96GN5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
CDCA7LQ96GN5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
CDCA7LQ96GN5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC37.91■■■■□ 3.66
CDCA7LQ96GN5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
CDCA7LQ96GN5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms