Protein–RNA interactions for Protein: Q96C12

ARMC5, Armadillo repeat-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 935 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARMC5Q96C12 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC39.82■■■■□ 3.97
ARMC5Q96C12 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC39.4■■■■□ 3.9
ARMC5Q96C12 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.36■■■■□ 3.89
ARMC5Q96C12 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
ARMC5Q96C12 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
ARMC5Q96C12 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
ARMC5Q96C12 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.68
ARMC5Q96C12 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
ARMC5Q96C12 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC37.9■■■■□ 3.66
ARMC5Q96C12 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
ARMC5Q96C12 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
ARMC5Q96C12 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC37.48■■■■□ 3.59
ARMC5Q96C12 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
ARMC5Q96C12 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
ARMC5Q96C12 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
ARMC5Q96C12 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
ARMC5Q96C12 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
ARMC5Q96C12 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
ARMC5Q96C12 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
ARMC5Q96C12 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
ARMC5Q96C12 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
ARMC5Q96C12 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
ARMC5Q96C12 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC36.76■■■■□ 3.48
ARMC5Q96C12 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
ARMC5Q96C12 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
ARMC5Q96C12 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
ARMC5Q96C12 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
ARMC5Q96C12 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
ARMC5Q96C12 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
ARMC5Q96C12 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
ARMC5Q96C12 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
ARMC5Q96C12 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
ARMC5Q96C12 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
ARMC5Q96C12 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
ARMC5Q96C12 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
ARMC5Q96C12 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
ARMC5Q96C12 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
ARMC5Q96C12 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
ARMC5Q96C12 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
ARMC5Q96C12 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
ARMC5Q96C12 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
ARMC5Q96C12 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
ARMC5Q96C12 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
ARMC5Q96C12 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
ARMC5Q96C12 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
ARMC5Q96C12 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
ARMC5Q96C12 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
ARMC5Q96C12 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
ARMC5Q96C12 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
ARMC5Q96C12 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
ARMC5Q96C12 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
ARMC5Q96C12 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
ARMC5Q96C12 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
ARMC5Q96C12 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
ARMC5Q96C12 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
ARMC5Q96C12 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
ARMC5Q96C12 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
ARMC5Q96C12 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC34.86■■■■□ 3.17
ARMC5Q96C12 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
ARMC5Q96C12 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
ARMC5Q96C12 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
ARMC5Q96C12 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
ARMC5Q96C12 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
ARMC5Q96C12 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
ARMC5Q96C12 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
ARMC5Q96C12 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
ARMC5Q96C12 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
ARMC5Q96C12 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
ARMC5Q96C12 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
ARMC5Q96C12 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
ARMC5Q96C12 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
ARMC5Q96C12 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
ARMC5Q96C12 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
ARMC5Q96C12 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
ARMC5Q96C12 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
ARMC5Q96C12 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
ARMC5Q96C12 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
ARMC5Q96C12 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
ARMC5Q96C12 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
ARMC5Q96C12 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
ARMC5Q96C12 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
ARMC5Q96C12 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
ARMC5Q96C12 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
ARMC5Q96C12 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ARMC5Q96C12 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
ARMC5Q96C12 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
ARMC5Q96C12 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
ARMC5Q96C12 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ARMC5Q96C12 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ARMC5Q96C12 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
ARMC5Q96C12 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
ARMC5Q96C12 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ARMC5Q96C12 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ARMC5Q96C12 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
ARMC5Q96C12 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ARMC5Q96C12 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ARMC5Q96C12 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
ARMC5Q96C12 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
ARMC5Q96C12 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
ARMC5Q96C12 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms