Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVM7

STAG1, Cohesin subunit SA-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG1Q8WVM7 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC40.64■■■■■ 4.1
STAG1Q8WVM7 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■□ 3.99
STAG1Q8WVM7 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC39.49■■■■□ 3.91
STAG1Q8WVM7 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.48■■■■□ 3.91
STAG1Q8WVM7 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
STAG1Q8WVM7 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
STAG1Q8WVM7 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC39.09■■■■□ 3.85
STAG1Q8WVM7 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC38.84■■■■□ 3.81
STAG1Q8WVM7 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
STAG1Q8WVM7 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
STAG1Q8WVM7 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.33■■■■□ 3.73
STAG1Q8WVM7 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
STAG1Q8WVM7 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.7
STAG1Q8WVM7 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
STAG1Q8WVM7 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
STAG1Q8WVM7 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
STAG1Q8WVM7 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
STAG1Q8WVM7 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC37.48■■■■□ 3.59
STAG1Q8WVM7 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
STAG1Q8WVM7 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.55
STAG1Q8WVM7 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC37.25■■■■□ 3.55
STAG1Q8WVM7 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
STAG1Q8WVM7 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
STAG1Q8WVM7 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
STAG1Q8WVM7 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
STAG1Q8WVM7 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
STAG1Q8WVM7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
STAG1Q8WVM7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
STAG1Q8WVM7 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
STAG1Q8WVM7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
STAG1Q8WVM7 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC36.46■■■■□ 3.43
STAG1Q8WVM7 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
STAG1Q8WVM7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
STAG1Q8WVM7 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
STAG1Q8WVM7 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
STAG1Q8WVM7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
STAG1Q8WVM7 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
STAG1Q8WVM7 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
STAG1Q8WVM7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
STAG1Q8WVM7 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
STAG1Q8WVM7 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
STAG1Q8WVM7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
STAG1Q8WVM7 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
STAG1Q8WVM7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
STAG1Q8WVM7 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
STAG1Q8WVM7 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
STAG1Q8WVM7 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
STAG1Q8WVM7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
STAG1Q8WVM7 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
STAG1Q8WVM7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
STAG1Q8WVM7 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
STAG1Q8WVM7 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
STAG1Q8WVM7 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
STAG1Q8WVM7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
STAG1Q8WVM7 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
STAG1Q8WVM7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
STAG1Q8WVM7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
STAG1Q8WVM7 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
STAG1Q8WVM7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
STAG1Q8WVM7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
STAG1Q8WVM7 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
STAG1Q8WVM7 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
STAG1Q8WVM7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
STAG1Q8WVM7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
STAG1Q8WVM7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
STAG1Q8WVM7 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
STAG1Q8WVM7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
STAG1Q8WVM7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
STAG1Q8WVM7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
STAG1Q8WVM7 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
STAG1Q8WVM7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC35.01■■■■□ 3.2
STAG1Q8WVM7 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
STAG1Q8WVM7 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
STAG1Q8WVM7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
STAG1Q8WVM7 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
STAG1Q8WVM7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
STAG1Q8WVM7 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.76■■■■□ 3.16
STAG1Q8WVM7 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
STAG1Q8WVM7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
STAG1Q8WVM7 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
STAG1Q8WVM7 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
STAG1Q8WVM7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
STAG1Q8WVM7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
STAG1Q8WVM7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
STAG1Q8WVM7 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
STAG1Q8WVM7 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
STAG1Q8WVM7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
STAG1Q8WVM7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
STAG1Q8WVM7 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
STAG1Q8WVM7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
STAG1Q8WVM7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
STAG1Q8WVM7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
STAG1Q8WVM7 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
STAG1Q8WVM7 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
STAG1Q8WVM7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
STAG1Q8WVM7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
STAG1Q8WVM7 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
STAG1Q8WVM7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
STAG1Q8WVM7 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
STAG1Q8WVM7 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms