Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF62

ATP8B4, Probable phospholipid-transporting ATPase IM, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B4Q8TF62 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC38.47■■■■□ 3.75
ATP8B4Q8TF62 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
ATP8B4Q8TF62 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC37.44■■■■□ 3.58
ATP8B4Q8TF62 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
ATP8B4Q8TF62 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
ATP8B4Q8TF62 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
ATP8B4Q8TF62 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
ATP8B4Q8TF62 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.77■■■■□ 3.48
ATP8B4Q8TF62 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
ATP8B4Q8TF62 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
ATP8B4Q8TF62 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
ATP8B4Q8TF62 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
ATP8B4Q8TF62 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
ATP8B4Q8TF62 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
ATP8B4Q8TF62 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
ATP8B4Q8TF62 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
ATP8B4Q8TF62 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
ATP8B4Q8TF62 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
ATP8B4Q8TF62 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
ATP8B4Q8TF62 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
ATP8B4Q8TF62 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
ATP8B4Q8TF62 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
ATP8B4Q8TF62 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
ATP8B4Q8TF62 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
ATP8B4Q8TF62 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
ATP8B4Q8TF62 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
ATP8B4Q8TF62 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
ATP8B4Q8TF62 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
ATP8B4Q8TF62 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
ATP8B4Q8TF62 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
ATP8B4Q8TF62 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
ATP8B4Q8TF62 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.48■■■■□ 3.11
ATP8B4Q8TF62 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
ATP8B4Q8TF62 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
ATP8B4Q8TF62 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
ATP8B4Q8TF62 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ATP8B4Q8TF62 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
ATP8B4Q8TF62 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ATP8B4Q8TF62 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
ATP8B4Q8TF62 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
ATP8B4Q8TF62 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
ATP8B4Q8TF62 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ATP8B4Q8TF62 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
ATP8B4Q8TF62 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
ATP8B4Q8TF62 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
ATP8B4Q8TF62 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
ATP8B4Q8TF62 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
ATP8B4Q8TF62 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ATP8B4Q8TF62 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
ATP8B4Q8TF62 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
ATP8B4Q8TF62 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
ATP8B4Q8TF62 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
ATP8B4Q8TF62 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
ATP8B4Q8TF62 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ATP8B4Q8TF62 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
ATP8B4Q8TF62 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
ATP8B4Q8TF62 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
ATP8B4Q8TF62 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
ATP8B4Q8TF62 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
ATP8B4Q8TF62 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
ATP8B4Q8TF62 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ATP8B4Q8TF62 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ATP8B4Q8TF62 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
ATP8B4Q8TF62 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
ATP8B4Q8TF62 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ATP8B4Q8TF62 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
ATP8B4Q8TF62 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ATP8B4Q8TF62 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
ATP8B4Q8TF62 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
ATP8B4Q8TF62 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
ATP8B4Q8TF62 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
ATP8B4Q8TF62 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
ATP8B4Q8TF62 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
ATP8B4Q8TF62 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
ATP8B4Q8TF62 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
ATP8B4Q8TF62 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
ATP8B4Q8TF62 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
ATP8B4Q8TF62 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
ATP8B4Q8TF62 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
ATP8B4Q8TF62 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
ATP8B4Q8TF62 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
ATP8B4Q8TF62 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
ATP8B4Q8TF62 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
ATP8B4Q8TF62 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
ATP8B4Q8TF62 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
ATP8B4Q8TF62 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
ATP8B4Q8TF62 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
ATP8B4Q8TF62 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
ATP8B4Q8TF62 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ATP8B4Q8TF62 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ATP8B4Q8TF62 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
ATP8B4Q8TF62 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ATP8B4Q8TF62 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ATP8B4Q8TF62 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ATP8B4Q8TF62 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
ATP8B4Q8TF62 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ATP8B4Q8TF62 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
ATP8B4Q8TF62 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
ATP8B4Q8TF62 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
ATP8B4Q8TF62 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms