Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDI8

TMC1, Transmembrane channel-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 760 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC1Q8TDI8 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC47.79■■■■■ 5.24
TMC1Q8TDI8 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC46.5■■■■■ 5.03
TMC1Q8TDI8 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.42■■■■■ 5.02
TMC1Q8TDI8 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.37■■■■■ 5.01
TMC1Q8TDI8 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.23■■■■■ 4.99
TMC1Q8TDI8 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.22■■■■■ 4.99
TMC1Q8TDI8 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC46.06■■■■■ 4.96
TMC1Q8TDI8 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.75■■■■■ 4.91
TMC1Q8TDI8 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
TMC1Q8TDI8 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC44.8■■■■■ 4.76
TMC1Q8TDI8 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.71■■■■■ 4.75
TMC1Q8TDI8 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.6■■■■■ 4.73
TMC1Q8TDI8 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC44.59■■■■■ 4.73
TMC1Q8TDI8 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC44.52■■■■■ 4.72
TMC1Q8TDI8 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC44.45■■■■■ 4.71
TMC1Q8TDI8 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC44.41■■■■■ 4.7
TMC1Q8TDI8 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
TMC1Q8TDI8 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC44.21■■■■■ 4.67
TMC1Q8TDI8 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC44.2■■■■■ 4.67
TMC1Q8TDI8 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
TMC1Q8TDI8 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
TMC1Q8TDI8 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.61
TMC1Q8TDI8 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.8■■■■■ 4.6
TMC1Q8TDI8 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.57
TMC1Q8TDI8 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
TMC1Q8TDI8 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
TMC1Q8TDI8 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
TMC1Q8TDI8 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC43.15■■■■■ 4.5
TMC1Q8TDI8 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
TMC1Q8TDI8 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC43.07■■■■■ 4.49
TMC1Q8TDI8 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC43.02■■■■■ 4.48
TMC1Q8TDI8 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.93■■■■■ 4.46
TMC1Q8TDI8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
TMC1Q8TDI8 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
TMC1Q8TDI8 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
TMC1Q8TDI8 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC42.64■■■■■ 4.42
TMC1Q8TDI8 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
TMC1Q8TDI8 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
TMC1Q8TDI8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
TMC1Q8TDI8 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC42.38■■■■■ 4.37
TMC1Q8TDI8 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.37■■■■■ 4.37
TMC1Q8TDI8 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC42.28■■■■■ 4.36
TMC1Q8TDI8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC42.23■■■■■ 4.35
TMC1Q8TDI8 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
TMC1Q8TDI8 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
TMC1Q8TDI8 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
TMC1Q8TDI8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC42.15■■■■■ 4.34
TMC1Q8TDI8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC42.09■■■■■ 4.33
TMC1Q8TDI8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.06■■■■■ 4.32
TMC1Q8TDI8 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.03■■■■■ 4.32
TMC1Q8TDI8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC42■■■■■ 4.31
TMC1Q8TDI8 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
TMC1Q8TDI8 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.91■■■■■ 4.3
TMC1Q8TDI8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
TMC1Q8TDI8 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC41.77■■■■■ 4.28
TMC1Q8TDI8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
TMC1Q8TDI8 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC41.66■■■■■ 4.26
TMC1Q8TDI8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
TMC1Q8TDI8 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.57■■■■■ 4.25
TMC1Q8TDI8 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
TMC1Q8TDI8 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
TMC1Q8TDI8 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.45■■■■■ 4.23
TMC1Q8TDI8 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
TMC1Q8TDI8 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC41.4■■■■■ 4.22
TMC1Q8TDI8 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
TMC1Q8TDI8 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
TMC1Q8TDI8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
TMC1Q8TDI8 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
TMC1Q8TDI8 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC41.19■■■■■ 4.18
TMC1Q8TDI8 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC41.19■■■■■ 4.18
TMC1Q8TDI8 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
TMC1Q8TDI8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
TMC1Q8TDI8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC41.08■■■■■ 4.17
TMC1Q8TDI8 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
TMC1Q8TDI8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
TMC1Q8TDI8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC41.01■■■■■ 4.16
TMC1Q8TDI8 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
TMC1Q8TDI8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
TMC1Q8TDI8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.84■■■■■ 4.13
TMC1Q8TDI8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC40.84■■■■■ 4.13
TMC1Q8TDI8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
TMC1Q8TDI8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
TMC1Q8TDI8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC40.79■■■■■ 4.12
TMC1Q8TDI8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC40.77■■■■■ 4.12
TMC1Q8TDI8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC40.74■■■■■ 4.11
TMC1Q8TDI8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
TMC1Q8TDI8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC40.7■■■■■ 4.11
TMC1Q8TDI8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
TMC1Q8TDI8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
TMC1Q8TDI8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.65■■■■■ 4.1
TMC1Q8TDI8 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.63■■■■■ 4.09
TMC1Q8TDI8 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
TMC1Q8TDI8 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC40.61■■■■■ 4.09
TMC1Q8TDI8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.61■■■■■ 4.09
TMC1Q8TDI8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
TMC1Q8TDI8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
TMC1Q8TDI8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC40.53■■■■■ 4.08
TMC1Q8TDI8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC40.52■■■■■ 4.08
TMC1Q8TDI8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
TMC1Q8TDI8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC40.49■■■■■ 4.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms