Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCG5

CHST4, Carbohydrate sulfotransferase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST4Q8NCG5 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CHST4Q8NCG5 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHST4Q8NCG5 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHST4Q8NCG5 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHST4Q8NCG5 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHST4Q8NCG5 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHST4Q8NCG5 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CHST4Q8NCG5 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHST4Q8NCG5 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHST4Q8NCG5 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHST4Q8NCG5 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHST4Q8NCG5 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CHST4Q8NCG5 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHST4Q8NCG5 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHST4Q8NCG5 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHST4Q8NCG5 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHST4Q8NCG5 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHST4Q8NCG5 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHST4Q8NCG5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHST4Q8NCG5 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHST4Q8NCG5 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CHST4Q8NCG5 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHST4Q8NCG5 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHST4Q8NCG5 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHST4Q8NCG5 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHST4Q8NCG5 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHST4Q8NCG5 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHST4Q8NCG5 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHST4Q8NCG5 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHST4Q8NCG5 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHST4Q8NCG5 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHST4Q8NCG5 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHST4Q8NCG5 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHST4Q8NCG5 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHST4Q8NCG5 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHST4Q8NCG5 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHST4Q8NCG5 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHST4Q8NCG5 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHST4Q8NCG5 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHST4Q8NCG5 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHST4Q8NCG5 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHST4Q8NCG5 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHST4Q8NCG5 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHST4Q8NCG5 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHST4Q8NCG5 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHST4Q8NCG5 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHST4Q8NCG5 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHST4Q8NCG5 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHST4Q8NCG5 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHST4Q8NCG5 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHST4Q8NCG5 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHST4Q8NCG5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHST4Q8NCG5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHST4Q8NCG5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHST4Q8NCG5 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHST4Q8NCG5 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHST4Q8NCG5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHST4Q8NCG5 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHST4Q8NCG5 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHST4Q8NCG5 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHST4Q8NCG5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHST4Q8NCG5 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHST4Q8NCG5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHST4Q8NCG5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHST4Q8NCG5 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHST4Q8NCG5 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHST4Q8NCG5 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHST4Q8NCG5 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHST4Q8NCG5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHST4Q8NCG5 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHST4Q8NCG5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHST4Q8NCG5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHST4Q8NCG5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHST4Q8NCG5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHST4Q8NCG5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHST4Q8NCG5 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHST4Q8NCG5 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHST4Q8NCG5 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHST4Q8NCG5 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHST4Q8NCG5 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHST4Q8NCG5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHST4Q8NCG5 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHST4Q8NCG5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHST4Q8NCG5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHST4Q8NCG5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHST4Q8NCG5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHST4Q8NCG5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHST4Q8NCG5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHST4Q8NCG5 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHST4Q8NCG5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHST4Q8NCG5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHST4Q8NCG5 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHST4Q8NCG5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHST4Q8NCG5 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHST4Q8NCG5 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHST4Q8NCG5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHST4Q8NCG5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHST4Q8NCG5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHST4Q8NCG5 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHST4Q8NCG5 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
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