Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC06

ACBD4, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD4Q8NC06 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ACBD4Q8NC06 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ACBD4Q8NC06 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ACBD4Q8NC06 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ACBD4Q8NC06 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ACBD4Q8NC06 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ACBD4Q8NC06 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ACBD4Q8NC06 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ACBD4Q8NC06 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ACBD4Q8NC06 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
ACBD4Q8NC06 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ACBD4Q8NC06 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ACBD4Q8NC06 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ACBD4Q8NC06 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ACBD4Q8NC06 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ACBD4Q8NC06 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ACBD4Q8NC06 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ACBD4Q8NC06 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ACBD4Q8NC06 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ACBD4Q8NC06 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ACBD4Q8NC06 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ACBD4Q8NC06 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ACBD4Q8NC06 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ACBD4Q8NC06 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ACBD4Q8NC06 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ACBD4Q8NC06 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ACBD4Q8NC06 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ACBD4Q8NC06 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ACBD4Q8NC06 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ACBD4Q8NC06 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ACBD4Q8NC06 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ACBD4Q8NC06 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ACBD4Q8NC06 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ACBD4Q8NC06 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ACBD4Q8NC06 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ACBD4Q8NC06 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ACBD4Q8NC06 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ACBD4Q8NC06 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ACBD4Q8NC06 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ACBD4Q8NC06 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ACBD4Q8NC06 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ACBD4Q8NC06 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ACBD4Q8NC06 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ACBD4Q8NC06 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ACBD4Q8NC06 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ACBD4Q8NC06 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ACBD4Q8NC06 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ACBD4Q8NC06 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ACBD4Q8NC06 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ACBD4Q8NC06 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ACBD4Q8NC06 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ACBD4Q8NC06 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
ACBD4Q8NC06 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ACBD4Q8NC06 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ACBD4Q8NC06 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ACBD4Q8NC06 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ACBD4Q8NC06 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ACBD4Q8NC06 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ACBD4Q8NC06 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ACBD4Q8NC06 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ACBD4Q8NC06 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ACBD4Q8NC06 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ACBD4Q8NC06 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ACBD4Q8NC06 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ACBD4Q8NC06 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ACBD4Q8NC06 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ACBD4Q8NC06 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ACBD4Q8NC06 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ACBD4Q8NC06 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ACBD4Q8NC06 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ACBD4Q8NC06 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ACBD4Q8NC06 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ACBD4Q8NC06 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ACBD4Q8NC06 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ACBD4Q8NC06 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACBD4Q8NC06 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ACBD4Q8NC06 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ACBD4Q8NC06 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ACBD4Q8NC06 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ACBD4Q8NC06 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ACBD4Q8NC06 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ACBD4Q8NC06 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ACBD4Q8NC06 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ACBD4Q8NC06 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ACBD4Q8NC06 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ACBD4Q8NC06 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ACBD4Q8NC06 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ACBD4Q8NC06 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ACBD4Q8NC06 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ACBD4Q8NC06 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ACBD4Q8NC06 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ACBD4Q8NC06 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ACBD4Q8NC06 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ACBD4Q8NC06 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ACBD4Q8NC06 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ACBD4Q8NC06 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ACBD4Q8NC06 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ACBD4Q8NC06 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ACBD4Q8NC06 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACBD4Q8NC06 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms