Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8J0

PI4KAP1, Putative inactive phosphatidylinositol 4-kinase alpha-like protein P1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4KAP1Q8N8J0 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC43.79■■■■■ 4.6
PI4KAP1Q8N8J0 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
PI4KAP1Q8N8J0 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
PI4KAP1Q8N8J0 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.43■■■■■ 4.38
PI4KAP1Q8N8J0 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC42.4■■■■■ 4.38
PI4KAP1Q8N8J0 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
PI4KAP1Q8N8J0 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC42.34■■■■■ 4.37
PI4KAP1Q8N8J0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.65■■■■■ 4.26
PI4KAP1Q8N8J0 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC41.37■■■■■ 4.21
PI4KAP1Q8N8J0 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
PI4KAP1Q8N8J0 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC41.09■■■■■ 4.17
PI4KAP1Q8N8J0 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.85■■■■■ 4.13
PI4KAP1Q8N8J0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC40.76■■■■■ 4.12
PI4KAP1Q8N8J0 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC40.74■■■■■ 4.11
PI4KAP1Q8N8J0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.74■■■■■ 4.11
PI4KAP1Q8N8J0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC40.57■■■■■ 4.09
PI4KAP1Q8N8J0 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
PI4KAP1Q8N8J0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
PI4KAP1Q8N8J0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC40.41■■■■■ 4.06
PI4KAP1Q8N8J0 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
PI4KAP1Q8N8J0 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.02
PI4KAP1Q8N8J0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
PI4KAP1Q8N8J0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
PI4KAP1Q8N8J0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
PI4KAP1Q8N8J0 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
PI4KAP1Q8N8J0 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
PI4KAP1Q8N8J0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
PI4KAP1Q8N8J0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
PI4KAP1Q8N8J0 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
PI4KAP1Q8N8J0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
PI4KAP1Q8N8J0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC39.26■■■■□ 3.88
PI4KAP1Q8N8J0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC39.2■■■■□ 3.87
PI4KAP1Q8N8J0 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
PI4KAP1Q8N8J0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC39.08■■■■□ 3.85
PI4KAP1Q8N8J0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.99■■■■□ 3.83
PI4KAP1Q8N8J0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
PI4KAP1Q8N8J0 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
PI4KAP1Q8N8J0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
PI4KAP1Q8N8J0 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC38.87■■■■□ 3.81
PI4KAP1Q8N8J0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC38.69■■■■□ 3.78
PI4KAP1Q8N8J0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
PI4KAP1Q8N8J0 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
PI4KAP1Q8N8J0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
PI4KAP1Q8N8J0 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
PI4KAP1Q8N8J0 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.56■■■■□ 3.76
PI4KAP1Q8N8J0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
PI4KAP1Q8N8J0 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
PI4KAP1Q8N8J0 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC38.45■■■■□ 3.75
PI4KAP1Q8N8J0 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC38.43■■■■□ 3.74
PI4KAP1Q8N8J0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC38.41■■■■□ 3.74
PI4KAP1Q8N8J0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
PI4KAP1Q8N8J0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
PI4KAP1Q8N8J0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
PI4KAP1Q8N8J0 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
PI4KAP1Q8N8J0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC38.16■■■■□ 3.7
PI4KAP1Q8N8J0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
PI4KAP1Q8N8J0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
PI4KAP1Q8N8J0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
PI4KAP1Q8N8J0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
PI4KAP1Q8N8J0 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
PI4KAP1Q8N8J0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
PI4KAP1Q8N8J0 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
PI4KAP1Q8N8J0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
PI4KAP1Q8N8J0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
PI4KAP1Q8N8J0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
PI4KAP1Q8N8J0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC37.7■■■■□ 3.62
PI4KAP1Q8N8J0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
PI4KAP1Q8N8J0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
PI4KAP1Q8N8J0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
PI4KAP1Q8N8J0 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
PI4KAP1Q8N8J0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC37.46■■■■□ 3.59
PI4KAP1Q8N8J0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
PI4KAP1Q8N8J0 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
PI4KAP1Q8N8J0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
PI4KAP1Q8N8J0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
PI4KAP1Q8N8J0 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
PI4KAP1Q8N8J0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.56
PI4KAP1Q8N8J0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
PI4KAP1Q8N8J0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
PI4KAP1Q8N8J0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
PI4KAP1Q8N8J0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
PI4KAP1Q8N8J0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
PI4KAP1Q8N8J0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
PI4KAP1Q8N8J0 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
PI4KAP1Q8N8J0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
PI4KAP1Q8N8J0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
PI4KAP1Q8N8J0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
PI4KAP1Q8N8J0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
PI4KAP1Q8N8J0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
PI4KAP1Q8N8J0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
PI4KAP1Q8N8J0 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
PI4KAP1Q8N8J0 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
PI4KAP1Q8N8J0 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
PI4KAP1Q8N8J0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
PI4KAP1Q8N8J0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
PI4KAP1Q8N8J0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
PI4KAP1Q8N8J0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
PI4KAP1Q8N8J0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
PI4KAP1Q8N8J0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
PI4KAP1Q8N8J0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms