Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZF0

NALCN, Sodium leak channel non-selective protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NALCNQ8IZF0 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC48.69■■■■■ 5.38
NALCNQ8IZF0 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC48.52■■■■■ 5.36
NALCNQ8IZF0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC47.93■■■■■ 5.26
NALCNQ8IZF0 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.58■■■■■ 5.21
NALCNQ8IZF0 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.14■■■■■ 5.14
NALCNQ8IZF0 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.77■■■■■ 5.08
NALCNQ8IZF0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.4■■■■■ 5.02
NALCNQ8IZF0 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.37■■■■■ 5.01
NALCNQ8IZF0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC46.37■■■■■ 5.01
NALCNQ8IZF0 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC46.32■■■■■ 5.01
NALCNQ8IZF0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.31■■■■■ 5
NALCNQ8IZF0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC46.18■■■■■ 4.98
NALCNQ8IZF0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC46.11■■■■■ 4.97
NALCNQ8IZF0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC46.07■■■■■ 4.97
NALCNQ8IZF0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.74■■■■■ 4.91
NALCNQ8IZF0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.61■■■■■ 4.89
NALCNQ8IZF0 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.54■■■■■ 4.88
NALCNQ8IZF0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.41■■■■■ 4.86
NALCNQ8IZF0 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.37■■■■■ 4.85
NALCNQ8IZF0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.06■■■■■ 4.8
NALCNQ8IZF0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
NALCNQ8IZF0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
NALCNQ8IZF0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
NALCNQ8IZF0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.81■■■■■ 4.76
NALCNQ8IZF0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC44.8■■■■■ 4.76
NALCNQ8IZF0 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.69■■■■■ 4.74
NALCNQ8IZF0 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC44.58■■■■■ 4.73
NALCNQ8IZF0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.54■■■■■ 4.72
NALCNQ8IZF0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC44.53■■■■■ 4.72
NALCNQ8IZF0 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
NALCNQ8IZF0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC44.31■■■■■ 4.68
NALCNQ8IZF0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC44.29■■■■■ 4.68
NALCNQ8IZF0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC44.28■■■■■ 4.68
NALCNQ8IZF0 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC44.17■■■■■ 4.66
NALCNQ8IZF0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC43.98■■■■■ 4.63
NALCNQ8IZF0 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC43.97■■■■■ 4.63
NALCNQ8IZF0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC43.85■■■■■ 4.61
NALCNQ8IZF0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
NALCNQ8IZF0 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
NALCNQ8IZF0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.57
NALCNQ8IZF0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC43.45■■■■■ 4.55
NALCNQ8IZF0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC43.38■■■■■ 4.53
NALCNQ8IZF0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
NALCNQ8IZF0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
NALCNQ8IZF0 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.49
NALCNQ8IZF0 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC43■■■■■ 4.47
NALCNQ8IZF0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC42.98■■■■■ 4.47
NALCNQ8IZF0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
NALCNQ8IZF0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
NALCNQ8IZF0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.84■■■■■ 4.45
NALCNQ8IZF0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC42.83■■■■■ 4.45
NALCNQ8IZF0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC42.8■■■■■ 4.44
NALCNQ8IZF0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
NALCNQ8IZF0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC42.77■■■■■ 4.44
NALCNQ8IZF0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
NALCNQ8IZF0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC42.68■■■■■ 4.42
NALCNQ8IZF0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
NALCNQ8IZF0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC42.66■■■■■ 4.42
NALCNQ8IZF0 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
NALCNQ8IZF0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
NALCNQ8IZF0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
NALCNQ8IZF0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
NALCNQ8IZF0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.51■■■■■ 4.4
NALCNQ8IZF0 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
NALCNQ8IZF0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
NALCNQ8IZF0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.45■■■■■ 4.39
NALCNQ8IZF0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
NALCNQ8IZF0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC42.32■■■■■ 4.36
NALCNQ8IZF0 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC42.27■■■■■ 4.36
NALCNQ8IZF0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.23■■■■■ 4.35
NALCNQ8IZF0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
NALCNQ8IZF0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
NALCNQ8IZF0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
NALCNQ8IZF0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
NALCNQ8IZF0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC42.12■■■■■ 4.33
NALCNQ8IZF0 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
NALCNQ8IZF0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC42.09■■■■■ 4.33
NALCNQ8IZF0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
NALCNQ8IZF0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
NALCNQ8IZF0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC42.05■■■■■ 4.32
NALCNQ8IZF0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC42.03■■■■■ 4.32
NALCNQ8IZF0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
NALCNQ8IZF0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC41.98■■■■■ 4.31
NALCNQ8IZF0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
NALCNQ8IZF0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
NALCNQ8IZF0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
NALCNQ8IZF0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
NALCNQ8IZF0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC41.88■■■■■ 4.3
NALCNQ8IZF0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC41.79■■■■■ 4.28
NALCNQ8IZF0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC41.79■■■■■ 4.28
NALCNQ8IZF0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC41.76■■■■■ 4.28
NALCNQ8IZF0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
NALCNQ8IZF0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC41.71■■■■■ 4.27
NALCNQ8IZF0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC41.69■■■■■ 4.26
NALCNQ8IZF0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
NALCNQ8IZF0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC41.67■■■■■ 4.26
NALCNQ8IZF0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
NALCNQ8IZF0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.64■■■■■ 4.26
NALCNQ8IZF0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC41.59■■■■■ 4.25
NALCNQ8IZF0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms