Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYA6

CKAP2L, Cytoskeleton-associated protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2LQ8IYA6 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC38.48■■■■□ 3.75
CKAP2LQ8IYA6 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
CKAP2LQ8IYA6 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC37.68■■■■□ 3.62
CKAP2LQ8IYA6 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
CKAP2LQ8IYA6 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC37.33■■■■□ 3.57
CKAP2LQ8IYA6 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
CKAP2LQ8IYA6 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
CKAP2LQ8IYA6 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
CKAP2LQ8IYA6 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
CKAP2LQ8IYA6 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
CKAP2LQ8IYA6 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
CKAP2LQ8IYA6 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
CKAP2LQ8IYA6 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CKAP2LQ8IYA6 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
CKAP2LQ8IYA6 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CKAP2LQ8IYA6 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CKAP2LQ8IYA6 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CKAP2LQ8IYA6 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CKAP2LQ8IYA6 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CKAP2LQ8IYA6 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CKAP2LQ8IYA6 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
CKAP2LQ8IYA6 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CKAP2LQ8IYA6 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
CKAP2LQ8IYA6 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35.7■■■■□ 3.31
CKAP2LQ8IYA6 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
CKAP2LQ8IYA6 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
CKAP2LQ8IYA6 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
CKAP2LQ8IYA6 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
CKAP2LQ8IYA6 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
CKAP2LQ8IYA6 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
CKAP2LQ8IYA6 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
CKAP2LQ8IYA6 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
CKAP2LQ8IYA6 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CKAP2LQ8IYA6 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CKAP2LQ8IYA6 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CKAP2LQ8IYA6 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CKAP2LQ8IYA6 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CKAP2LQ8IYA6 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CKAP2LQ8IYA6 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CKAP2LQ8IYA6 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CKAP2LQ8IYA6 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
CKAP2LQ8IYA6 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
CKAP2LQ8IYA6 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
CKAP2LQ8IYA6 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CKAP2LQ8IYA6 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CKAP2LQ8IYA6 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CKAP2LQ8IYA6 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CKAP2LQ8IYA6 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CKAP2LQ8IYA6 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CKAP2LQ8IYA6 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CKAP2LQ8IYA6 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CKAP2LQ8IYA6 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CKAP2LQ8IYA6 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CKAP2LQ8IYA6 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CKAP2LQ8IYA6 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CKAP2LQ8IYA6 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CKAP2LQ8IYA6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CKAP2LQ8IYA6 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CKAP2LQ8IYA6 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CKAP2LQ8IYA6 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CKAP2LQ8IYA6 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CKAP2LQ8IYA6 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CKAP2LQ8IYA6 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CKAP2LQ8IYA6 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
CKAP2LQ8IYA6 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CKAP2LQ8IYA6 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CKAP2LQ8IYA6 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CKAP2LQ8IYA6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CKAP2LQ8IYA6 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CKAP2LQ8IYA6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CKAP2LQ8IYA6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CKAP2LQ8IYA6 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
CKAP2LQ8IYA6 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CKAP2LQ8IYA6 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
CKAP2LQ8IYA6 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CKAP2LQ8IYA6 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CKAP2LQ8IYA6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
CKAP2LQ8IYA6 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CKAP2LQ8IYA6 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CKAP2LQ8IYA6 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CKAP2LQ8IYA6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
CKAP2LQ8IYA6 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CKAP2LQ8IYA6 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CKAP2LQ8IYA6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CKAP2LQ8IYA6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CKAP2LQ8IYA6 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CKAP2LQ8IYA6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CKAP2LQ8IYA6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CKAP2LQ8IYA6 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CKAP2LQ8IYA6 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CKAP2LQ8IYA6 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CKAP2LQ8IYA6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CKAP2LQ8IYA6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CKAP2LQ8IYA6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CKAP2LQ8IYA6 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CKAP2LQ8IYA6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CKAP2LQ8IYA6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CKAP2LQ8IYA6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CKAP2LQ8IYA6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CKAP2LQ8IYA6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms