Protein–RNA interactions for Protein: Q86YJ5

MARCH9, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH9, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH9Q86YJ5 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
MARCH9Q86YJ5 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
MARCH9Q86YJ5 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
MARCH9Q86YJ5 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
MARCH9Q86YJ5 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
MARCH9Q86YJ5 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
MARCH9Q86YJ5 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
MARCH9Q86YJ5 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
MARCH9Q86YJ5 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
MARCH9Q86YJ5 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
MARCH9Q86YJ5 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
MARCH9Q86YJ5 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
MARCH9Q86YJ5 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
MARCH9Q86YJ5 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
MARCH9Q86YJ5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
MARCH9Q86YJ5 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
MARCH9Q86YJ5 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
MARCH9Q86YJ5 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
MARCH9Q86YJ5 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
MARCH9Q86YJ5 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
MARCH9Q86YJ5 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
MARCH9Q86YJ5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
MARCH9Q86YJ5 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
MARCH9Q86YJ5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
MARCH9Q86YJ5 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
MARCH9Q86YJ5 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
MARCH9Q86YJ5 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
MARCH9Q86YJ5 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
MARCH9Q86YJ5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
MARCH9Q86YJ5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
MARCH9Q86YJ5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
MARCH9Q86YJ5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
MARCH9Q86YJ5 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
MARCH9Q86YJ5 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
MARCH9Q86YJ5 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
MARCH9Q86YJ5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
MARCH9Q86YJ5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30■■■□□ 2.39
MARCH9Q86YJ5 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
MARCH9Q86YJ5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
MARCH9Q86YJ5 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
MARCH9Q86YJ5 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
MARCH9Q86YJ5 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
MARCH9Q86YJ5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
MARCH9Q86YJ5 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
MARCH9Q86YJ5 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
MARCH9Q86YJ5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
MARCH9Q86YJ5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
MARCH9Q86YJ5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
MARCH9Q86YJ5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MARCH9Q86YJ5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MARCH9Q86YJ5 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MARCH9Q86YJ5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MARCH9Q86YJ5 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MARCH9Q86YJ5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
MARCH9Q86YJ5 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MARCH9Q86YJ5 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MARCH9Q86YJ5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MARCH9Q86YJ5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MARCH9Q86YJ5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MARCH9Q86YJ5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
MARCH9Q86YJ5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MARCH9Q86YJ5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MARCH9Q86YJ5 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MARCH9Q86YJ5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MARCH9Q86YJ5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MARCH9Q86YJ5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MARCH9Q86YJ5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MARCH9Q86YJ5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
MARCH9Q86YJ5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MARCH9Q86YJ5 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MARCH9Q86YJ5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MARCH9Q86YJ5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MARCH9Q86YJ5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MARCH9Q86YJ5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
MARCH9Q86YJ5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MARCH9Q86YJ5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MARCH9Q86YJ5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
MARCH9Q86YJ5 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MARCH9Q86YJ5 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MARCH9Q86YJ5 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MARCH9Q86YJ5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MARCH9Q86YJ5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MARCH9Q86YJ5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MARCH9Q86YJ5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MARCH9Q86YJ5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MARCH9Q86YJ5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MARCH9Q86YJ5 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MARCH9Q86YJ5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MARCH9Q86YJ5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MARCH9Q86YJ5 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MARCH9Q86YJ5 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MARCH9Q86YJ5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MARCH9Q86YJ5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MARCH9Q86YJ5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
MARCH9Q86YJ5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MARCH9Q86YJ5 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MARCH9Q86YJ5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MARCH9Q86YJ5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MARCH9Q86YJ5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MARCH9Q86YJ5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms