Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ3

TXNDC2, Thioredoxin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC2Q86VQ3 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC50.14■■■■■ 5.62
TXNDC2Q86VQ3 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC50.05■■■■■ 5.6
TXNDC2Q86VQ3 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC49.44■■■■■ 5.51
TXNDC2Q86VQ3 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.96■■■■■ 5.43
TXNDC2Q86VQ3 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.43■■■■■ 5.34
TXNDC2Q86VQ3 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48■■■■■ 5.28
TXNDC2Q86VQ3 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.91■■■■■ 5.26
TXNDC2Q86VQ3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.77■■■■■ 5.24
TXNDC2Q86VQ3 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC47.69■■■■■ 5.22
TXNDC2Q86VQ3 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC47.61■■■■■ 5.21
TXNDC2Q86VQ3 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.55■■■■■ 5.2
TXNDC2Q86VQ3 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC47.51■■■■■ 5.2
TXNDC2Q86VQ3 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC47.34■■■■■ 5.17
TXNDC2Q86VQ3 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC47.32■■■■■ 5.17
TXNDC2Q86VQ3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.21■■■■■ 5.15
TXNDC2Q86VQ3 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.04■■■■■ 5.12
TXNDC2Q86VQ3 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.68■■■■■ 5.06
TXNDC2Q86VQ3 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.65■■■■■ 5.06
TXNDC2Q86VQ3 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC46.42■■■■■ 5.02
TXNDC2Q86VQ3 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.37■■■■■ 5.01
TXNDC2Q86VQ3 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC46.37■■■■■ 5.01
TXNDC2Q86VQ3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.36■■■■■ 5.01
TXNDC2Q86VQ3 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC46.31■■■■■ 5
TXNDC2Q86VQ3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.27■■■■■ 5
TXNDC2Q86VQ3 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.26■■■■■ 5
TXNDC2Q86VQ3 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.13■■■■■ 4.98
TXNDC2Q86VQ3 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC46.07■■■■■ 4.97
TXNDC2Q86VQ3 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.89■■■■■ 4.94
TXNDC2Q86VQ3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC45.77■■■■■ 4.92
TXNDC2Q86VQ3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC45.72■■■■■ 4.91
TXNDC2Q86VQ3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC45.57■■■■■ 4.89
TXNDC2Q86VQ3 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC45.46■■■■■ 4.87
TXNDC2Q86VQ3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.44■■■■■ 4.86
TXNDC2Q86VQ3 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.4■■■■■ 4.86
TXNDC2Q86VQ3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC45.28■■■■■ 4.84
TXNDC2Q86VQ3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC45.27■■■■■ 4.84
TXNDC2Q86VQ3 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC45.18■■■■■ 4.82
TXNDC2Q86VQ3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC45.15■■■■■ 4.82
TXNDC2Q86VQ3 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC45■■■■■ 4.79
TXNDC2Q86VQ3 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.86■■■■■ 4.77
TXNDC2Q86VQ3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC44.6■■■■■ 4.73
TXNDC2Q86VQ3 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC44.57■■■■■ 4.73
TXNDC2Q86VQ3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
TXNDC2Q86VQ3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.44■■■■■ 4.7
TXNDC2Q86VQ3 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
TXNDC2Q86VQ3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC44.3■■■■■ 4.68
TXNDC2Q86VQ3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
TXNDC2Q86VQ3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC44.29■■■■■ 4.68
TXNDC2Q86VQ3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
TXNDC2Q86VQ3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
TXNDC2Q86VQ3 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC44.16■■■■■ 4.66
TXNDC2Q86VQ3 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
TXNDC2Q86VQ3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC44.1■■■■■ 4.65
TXNDC2Q86VQ3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
TXNDC2Q86VQ3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC44.08■■■■■ 4.65
TXNDC2Q86VQ3 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
TXNDC2Q86VQ3 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
TXNDC2Q86VQ3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
TXNDC2Q86VQ3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC44■■■■■ 4.63
TXNDC2Q86VQ3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC43.91■■■■■ 4.62
TXNDC2Q86VQ3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC43.83■■■■■ 4.61
TXNDC2Q86VQ3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.61
TXNDC2Q86VQ3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.75■■■■■ 4.59
TXNDC2Q86VQ3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.69■■■■■ 4.58
TXNDC2Q86VQ3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC43.65■■■■■ 4.58
TXNDC2Q86VQ3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
TXNDC2Q86VQ3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
TXNDC2Q86VQ3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC43.53■■■■■ 4.56
TXNDC2Q86VQ3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC43.53■■■■■ 4.56
TXNDC2Q86VQ3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
TXNDC2Q86VQ3 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
TXNDC2Q86VQ3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
TXNDC2Q86VQ3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC43.43■■■■■ 4.54
TXNDC2Q86VQ3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
TXNDC2Q86VQ3 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
TXNDC2Q86VQ3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
TXNDC2Q86VQ3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
TXNDC2Q86VQ3 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
TXNDC2Q86VQ3 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
TXNDC2Q86VQ3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC43.29■■■■■ 4.52
TXNDC2Q86VQ3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
TXNDC2Q86VQ3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC43.22■■■■■ 4.51
TXNDC2Q86VQ3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
TXNDC2Q86VQ3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC43.2■■■■■ 4.51
TXNDC2Q86VQ3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
TXNDC2Q86VQ3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC43.17■■■■■ 4.5
TXNDC2Q86VQ3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC43.11■■■■■ 4.49
TXNDC2Q86VQ3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC43.1■■■■■ 4.49
TXNDC2Q86VQ3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.06■■■■■ 4.48
TXNDC2Q86VQ3 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
TXNDC2Q86VQ3 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
TXNDC2Q86VQ3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC42.98■■■■■ 4.47
TXNDC2Q86VQ3 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC42.96■■■■■ 4.47
TXNDC2Q86VQ3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC42.92■■■■■ 4.46
TXNDC2Q86VQ3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC42.92■■■■■ 4.46
TXNDC2Q86VQ3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC42.91■■■■■ 4.46
TXNDC2Q86VQ3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
TXNDC2Q86VQ3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC42.9■■■■■ 4.46
TXNDC2Q86VQ3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
TXNDC2Q86VQ3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 565.1 ms