Protein–RNA interactions for Protein: Q86UF1

TSPAN33, Tetraspanin-33, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN33Q86UF1 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.37■■■■□ 3.09
TSPAN33Q86UF1 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
TSPAN33Q86UF1 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
TSPAN33Q86UF1 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
TSPAN33Q86UF1 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
TSPAN33Q86UF1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
TSPAN33Q86UF1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
TSPAN33Q86UF1 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
TSPAN33Q86UF1 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
TSPAN33Q86UF1 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
TSPAN33Q86UF1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TSPAN33Q86UF1 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
TSPAN33Q86UF1 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
TSPAN33Q86UF1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TSPAN33Q86UF1 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
TSPAN33Q86UF1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
TSPAN33Q86UF1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
TSPAN33Q86UF1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
TSPAN33Q86UF1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
TSPAN33Q86UF1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
TSPAN33Q86UF1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
TSPAN33Q86UF1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
TSPAN33Q86UF1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TSPAN33Q86UF1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
TSPAN33Q86UF1 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
TSPAN33Q86UF1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TSPAN33Q86UF1 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
TSPAN33Q86UF1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TSPAN33Q86UF1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TSPAN33Q86UF1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
TSPAN33Q86UF1 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
TSPAN33Q86UF1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TSPAN33Q86UF1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TSPAN33Q86UF1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
TSPAN33Q86UF1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
TSPAN33Q86UF1 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
TSPAN33Q86UF1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
TSPAN33Q86UF1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
TSPAN33Q86UF1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
TSPAN33Q86UF1 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
TSPAN33Q86UF1 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
TSPAN33Q86UF1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
TSPAN33Q86UF1 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TSPAN33Q86UF1 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TSPAN33Q86UF1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TSPAN33Q86UF1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TSPAN33Q86UF1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TSPAN33Q86UF1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TSPAN33Q86UF1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
TSPAN33Q86UF1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TSPAN33Q86UF1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TSPAN33Q86UF1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TSPAN33Q86UF1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TSPAN33Q86UF1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TSPAN33Q86UF1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TSPAN33Q86UF1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TSPAN33Q86UF1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TSPAN33Q86UF1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TSPAN33Q86UF1 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TSPAN33Q86UF1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
TSPAN33Q86UF1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
TSPAN33Q86UF1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TSPAN33Q86UF1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TSPAN33Q86UF1 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TSPAN33Q86UF1 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TSPAN33Q86UF1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TSPAN33Q86UF1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
TSPAN33Q86UF1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TSPAN33Q86UF1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TSPAN33Q86UF1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TSPAN33Q86UF1 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TSPAN33Q86UF1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TSPAN33Q86UF1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TSPAN33Q86UF1 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TSPAN33Q86UF1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TSPAN33Q86UF1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TSPAN33Q86UF1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TSPAN33Q86UF1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TSPAN33Q86UF1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TSPAN33Q86UF1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TSPAN33Q86UF1 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TSPAN33Q86UF1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TSPAN33Q86UF1 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TSPAN33Q86UF1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TSPAN33Q86UF1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TSPAN33Q86UF1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TSPAN33Q86UF1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TSPAN33Q86UF1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TSPAN33Q86UF1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TSPAN33Q86UF1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TSPAN33Q86UF1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TSPAN33Q86UF1 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TSPAN33Q86UF1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TSPAN33Q86UF1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TSPAN33Q86UF1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TSPAN33Q86UF1 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TSPAN33Q86UF1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TSPAN33Q86UF1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TSPAN33Q86UF1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TSPAN33Q86UF1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.5 ms