Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS6

OTOP2, Otopetrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP2Q7RTS6 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC37.92■■■■□ 3.66
OTOP2Q7RTS6 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC37.74■■■■□ 3.63
OTOP2Q7RTS6 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.27■■■■□ 3.56
OTOP2Q7RTS6 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
OTOP2Q7RTS6 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
OTOP2Q7RTS6 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
OTOP2Q7RTS6 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
OTOP2Q7RTS6 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
OTOP2Q7RTS6 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
OTOP2Q7RTS6 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
OTOP2Q7RTS6 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC36■■■■□ 3.35
OTOP2Q7RTS6 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
OTOP2Q7RTS6 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35.76■■■■□ 3.32
OTOP2Q7RTS6 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
OTOP2Q7RTS6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
OTOP2Q7RTS6 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
OTOP2Q7RTS6 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.25
OTOP2Q7RTS6 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
OTOP2Q7RTS6 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
OTOP2Q7RTS6 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
OTOP2Q7RTS6 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
OTOP2Q7RTS6 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
OTOP2Q7RTS6 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
OTOP2Q7RTS6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
OTOP2Q7RTS6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
OTOP2Q7RTS6 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
OTOP2Q7RTS6 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
OTOP2Q7RTS6 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
OTOP2Q7RTS6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
OTOP2Q7RTS6 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
OTOP2Q7RTS6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
OTOP2Q7RTS6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
OTOP2Q7RTS6 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
OTOP2Q7RTS6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
OTOP2Q7RTS6 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
OTOP2Q7RTS6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
OTOP2Q7RTS6 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
OTOP2Q7RTS6 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
OTOP2Q7RTS6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
OTOP2Q7RTS6 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
OTOP2Q7RTS6 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
OTOP2Q7RTS6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
OTOP2Q7RTS6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
OTOP2Q7RTS6 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
OTOP2Q7RTS6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
OTOP2Q7RTS6 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
OTOP2Q7RTS6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
OTOP2Q7RTS6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
OTOP2Q7RTS6 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
OTOP2Q7RTS6 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
OTOP2Q7RTS6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
OTOP2Q7RTS6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
OTOP2Q7RTS6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
OTOP2Q7RTS6 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
OTOP2Q7RTS6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
OTOP2Q7RTS6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
OTOP2Q7RTS6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
OTOP2Q7RTS6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
OTOP2Q7RTS6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
OTOP2Q7RTS6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
OTOP2Q7RTS6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
OTOP2Q7RTS6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
OTOP2Q7RTS6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
OTOP2Q7RTS6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
OTOP2Q7RTS6 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
OTOP2Q7RTS6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
OTOP2Q7RTS6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
OTOP2Q7RTS6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
OTOP2Q7RTS6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
OTOP2Q7RTS6 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
OTOP2Q7RTS6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
OTOP2Q7RTS6 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
OTOP2Q7RTS6 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
OTOP2Q7RTS6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
OTOP2Q7RTS6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
OTOP2Q7RTS6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC32.78■■■□□ 2.84
OTOP2Q7RTS6 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
OTOP2Q7RTS6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
OTOP2Q7RTS6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
OTOP2Q7RTS6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
OTOP2Q7RTS6 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
OTOP2Q7RTS6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
OTOP2Q7RTS6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
OTOP2Q7RTS6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
OTOP2Q7RTS6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
OTOP2Q7RTS6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.6■■■□□ 2.81
OTOP2Q7RTS6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
OTOP2Q7RTS6 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
OTOP2Q7RTS6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
OTOP2Q7RTS6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
OTOP2Q7RTS6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
OTOP2Q7RTS6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
OTOP2Q7RTS6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
OTOP2Q7RTS6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
OTOP2Q7RTS6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
OTOP2Q7RTS6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
OTOP2Q7RTS6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
OTOP2Q7RTS6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
OTOP2Q7RTS6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
OTOP2Q7RTS6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms