Protein–RNA interactions for Protein: Q75N90

FBN3, Fibrillin-3, humanhuman

Predictions only

Length 2,809 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBN3Q75N90 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FBN3Q75N90 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FBN3Q75N90 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FBN3Q75N90 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FBN3Q75N90 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FBN3Q75N90 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FBN3Q75N90 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FBN3Q75N90 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FBN3Q75N90 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FBN3Q75N90 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FBN3Q75N90 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FBN3Q75N90 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FBN3Q75N90 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FBN3Q75N90 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
FBN3Q75N90 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
FBN3Q75N90 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
FBN3Q75N90 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FBN3Q75N90 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FBN3Q75N90 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FBN3Q75N90 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
FBN3Q75N90 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBN3Q75N90 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FBN3Q75N90 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FBN3Q75N90 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FBN3Q75N90 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FBN3Q75N90 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FBN3Q75N90 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FBN3Q75N90 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FBN3Q75N90 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FBN3Q75N90 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
FBN3Q75N90 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
FBN3Q75N90 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FBN3Q75N90 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FBN3Q75N90 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FBN3Q75N90 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FBN3Q75N90 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FBN3Q75N90 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FBN3Q75N90 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FBN3Q75N90 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FBN3Q75N90 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FBN3Q75N90 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FBN3Q75N90 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FBN3Q75N90 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FBN3Q75N90 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FBN3Q75N90 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FBN3Q75N90 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FBN3Q75N90 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBN3Q75N90 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
FBN3Q75N90 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FBN3Q75N90 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FBN3Q75N90 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FBN3Q75N90 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FBN3Q75N90 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FBN3Q75N90 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FBN3Q75N90 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FBN3Q75N90 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBN3Q75N90 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBN3Q75N90 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FBN3Q75N90 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FBN3Q75N90 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FBN3Q75N90 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FBN3Q75N90 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBN3Q75N90 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBN3Q75N90 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FBN3Q75N90 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FBN3Q75N90 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBN3Q75N90 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FBN3Q75N90 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FBN3Q75N90 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBN3Q75N90 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FBN3Q75N90 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FBN3Q75N90 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FBN3Q75N90 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBN3Q75N90 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBN3Q75N90 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBN3Q75N90 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
FBN3Q75N90 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBN3Q75N90 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FBN3Q75N90 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
FBN3Q75N90 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
FBN3Q75N90 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FBN3Q75N90 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FBN3Q75N90 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FBN3Q75N90 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FBN3Q75N90 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FBN3Q75N90 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FBN3Q75N90 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBN3Q75N90 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBN3Q75N90 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBN3Q75N90 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
FBN3Q75N90 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBN3Q75N90 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBN3Q75N90 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBN3Q75N90 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBN3Q75N90 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBN3Q75N90 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
FBN3Q75N90 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FBN3Q75N90 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBN3Q75N90 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
FBN3Q75N90 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms