Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNL6

FGD5, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD5Q6ZNL6 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC58.97■■■■■ 7.03
FGD5Q6ZNL6 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC58.72■■■■■ 6.99
FGD5Q6ZNL6 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC57.93■■■■■ 6.86
FGD5Q6ZNL6 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.61■■■■■ 6.81
FGD5Q6ZNL6 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.04■■■■■ 6.72
FGD5Q6ZNL6 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC56.58■■■■■ 6.65
FGD5Q6ZNL6 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.18■■■■■ 6.58
FGD5Q6ZNL6 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC56.12■■■■■ 6.57
FGD5Q6ZNL6 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC56.06■■■■■ 6.57
FGD5Q6ZNL6 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC55.97■■■■■ 6.55
FGD5Q6ZNL6 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC55.88■■■■■ 6.54
FGD5Q6ZNL6 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC55.76■■■■■ 6.52
FGD5Q6ZNL6 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC55.71■■■■■ 6.51
FGD5Q6ZNL6 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC55.68■■■■■ 6.5
FGD5Q6ZNL6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.25■■■■■ 6.44
FGD5Q6ZNL6 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.11■■■■■ 6.41
FGD5Q6ZNL6 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC54.98■■■■■ 6.39
FGD5Q6ZNL6 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC54.92■■■■■ 6.38
FGD5Q6ZNL6 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC54.83■■■■■ 6.37
FGD5Q6ZNL6 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.37■■■■■ 6.29
FGD5Q6ZNL6 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC54.37■■■■■ 6.29
FGD5Q6ZNL6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC54.34■■■■■ 6.29
FGD5Q6ZNL6 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC54.2■■■■■ 6.27
FGD5Q6ZNL6 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.16■■■■■ 6.26
FGD5Q6ZNL6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.13■■■■■ 6.26
FGD5Q6ZNL6 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC54.1■■■■■ 6.25
FGD5Q6ZNL6 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC53.94■■■■■ 6.23
FGD5Q6ZNL6 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC53.92■■■■■ 6.22
FGD5Q6ZNL6 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC53.9■■■■■ 6.22
FGD5Q6ZNL6 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.72■■■■■ 6.19
FGD5Q6ZNL6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC53.53■■■■■ 6.16
FGD5Q6ZNL6 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC53.52■■■■■ 6.16
FGD5Q6ZNL6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC53.51■■■■■ 6.16
FGD5Q6ZNL6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC53.5■■■■■ 6.15
FGD5Q6ZNL6 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC53.23■■■■■ 6.11
FGD5Q6ZNL6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC53.05■■■■■ 6.08
FGD5Q6ZNL6 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC53.05■■■■■ 6.08
FGD5Q6ZNL6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC53.01■■■■■ 6.08
FGD5Q6ZNL6 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.89■■■■■ 6.06
FGD5Q6ZNL6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC52.69■■■■■ 6.03
FGD5Q6ZNL6 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC52.52■■■■■ 6
FGD5Q6ZNL6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC52.3■■■■■ 5.96
FGD5Q6ZNL6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC52.19■■■■■ 5.95
FGD5Q6ZNL6 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC52.18■■■■■ 5.94
FGD5Q6ZNL6 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC52.12■■■■■ 5.93
FGD5Q6ZNL6 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.97■■■■■ 5.91
FGD5Q6ZNL6 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC51.95■■■■■ 5.91
FGD5Q6ZNL6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC51.93■■■■■ 5.9
FGD5Q6ZNL6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC51.92■■■■■ 5.9
FGD5Q6ZNL6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.8■■■■■ 5.88
FGD5Q6ZNL6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC51.77■■■■■ 5.88
FGD5Q6ZNL6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC51.72■■■■■ 5.87
FGD5Q6ZNL6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC51.68■■■■■ 5.86
FGD5Q6ZNL6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC51.64■■■■■ 5.86
FGD5Q6ZNL6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC51.64■■■■■ 5.86
FGD5Q6ZNL6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC51.64■■■■■ 5.86
FGD5Q6ZNL6 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.63■■■■■ 5.86
FGD5Q6ZNL6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.62■■■■■ 5.85
FGD5Q6ZNL6 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.62■■■■■ 5.85
FGD5Q6ZNL6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC51.57■■■■■ 5.85
FGD5Q6ZNL6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC51.56■■■■■ 5.84
FGD5Q6ZNL6 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.36■■■■■ 5.81
FGD5Q6ZNL6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.35■■■■■ 5.81
FGD5Q6ZNL6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC51.28■■■■■ 5.8
FGD5Q6ZNL6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC51.25■■■■■ 5.79
FGD5Q6ZNL6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC51.19■■■■■ 5.78
FGD5Q6ZNL6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.16■■■■■ 5.78
FGD5Q6ZNL6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC51.15■■■■■ 5.78
FGD5Q6ZNL6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.05■■■■■ 5.76
FGD5Q6ZNL6 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.03■■■■■ 5.76
FGD5Q6ZNL6 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC51.02■■■■■ 5.76
FGD5Q6ZNL6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.98■■■■■ 5.75
FGD5Q6ZNL6 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC50.98■■■■■ 5.75
FGD5Q6ZNL6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.98■■■■■ 5.75
FGD5Q6ZNL6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC50.92■■■■■ 5.74
FGD5Q6ZNL6 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.9■■■■■ 5.74
FGD5Q6ZNL6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.9■■■■■ 5.74
FGD5Q6ZNL6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC50.9■■■■■ 5.74
FGD5Q6ZNL6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC50.85■■■■■ 5.73
FGD5Q6ZNL6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC50.85■■■■■ 5.73
FGD5Q6ZNL6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC50.84■■■■■ 5.73
FGD5Q6ZNL6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC50.82■■■■■ 5.73
FGD5Q6ZNL6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC50.79■■■■■ 5.72
FGD5Q6ZNL6 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.76■■■■■ 5.72
FGD5Q6ZNL6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.73■■■■■ 5.71
FGD5Q6ZNL6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.7■■■■■ 5.71
FGD5Q6ZNL6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.67■■■■■ 5.7
FGD5Q6ZNL6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC50.66■■■■■ 5.7
FGD5Q6ZNL6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC50.51■■■■■ 5.68
FGD5Q6ZNL6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC50.46■■■■■ 5.67
FGD5Q6ZNL6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC50.43■■■■■ 5.66
FGD5Q6ZNL6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC50.43■■■■■ 5.66
FGD5Q6ZNL6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC50.38■■■■■ 5.66
FGD5Q6ZNL6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.35■■■■■ 5.65
FGD5Q6ZNL6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.34■■■■■ 5.65
FGD5Q6ZNL6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC50.33■■■■■ 5.65
FGD5Q6ZNL6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC50.32■■■■■ 5.65
FGD5Q6ZNL6 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC50.26■■■■■ 5.64
FGD5Q6ZNL6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.24■■■■■ 5.63
FGD5Q6ZNL6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC50.24■■■■■ 5.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms