Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC47.56■■■■■ 5.2
LMOD2Q6P5Q4 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC47.23■■■■■ 5.15
LMOD2Q6P5Q4 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC46.64■■■■■ 5.06
LMOD2Q6P5Q4 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.33■■■■■ 5.01
LMOD2Q6P5Q4 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.98■■■■■ 4.95
LMOD2Q6P5Q4 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.65■■■■■ 4.9
LMOD2Q6P5Q4 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.31■■■■■ 4.84
LMOD2Q6P5Q4 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
LMOD2Q6P5Q4 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC45.22■■■■■ 4.83
LMOD2Q6P5Q4 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC45.14■■■■■ 4.82
LMOD2Q6P5Q4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
LMOD2Q6P5Q4 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC45.02■■■■■ 4.8
LMOD2Q6P5Q4 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC44.82■■■■■ 4.77
LMOD2Q6P5Q4 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC44.78■■■■■ 4.76
LMOD2Q6P5Q4 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
LMOD2Q6P5Q4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
LMOD2Q6P5Q4 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.32■■■■■ 4.69
LMOD2Q6P5Q4 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
LMOD2Q6P5Q4 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.67
LMOD2Q6P5Q4 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
LMOD2Q6P5Q4 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
LMOD2Q6P5Q4 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC43.84■■■■■ 4.61
LMOD2Q6P5Q4 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.81■■■■■ 4.6
LMOD2Q6P5Q4 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
LMOD2Q6P5Q4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
LMOD2Q6P5Q4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.61■■■■■ 4.57
LMOD2Q6P5Q4 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC43.59■■■■■ 4.57
LMOD2Q6P5Q4 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.53■■■■■ 4.56
LMOD2Q6P5Q4 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC43.33■■■■■ 4.53
LMOD2Q6P5Q4 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
LMOD2Q6P5Q4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC43.12■■■■■ 4.49
LMOD2Q6P5Q4 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC43.09■■■■■ 4.49
LMOD2Q6P5Q4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC43.08■■■■■ 4.49
LMOD2Q6P5Q4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC43.07■■■■■ 4.49
LMOD2Q6P5Q4 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC42.95■■■■■ 4.47
LMOD2Q6P5Q4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
LMOD2Q6P5Q4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC42.85■■■■■ 4.45
LMOD2Q6P5Q4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC42.79■■■■■ 4.44
LMOD2Q6P5Q4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
LMOD2Q6P5Q4 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
LMOD2Q6P5Q4 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC42.35■■■■■ 4.37
LMOD2Q6P5Q4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
LMOD2Q6P5Q4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC42.07■■■■■ 4.33
LMOD2Q6P5Q4 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
LMOD2Q6P5Q4 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
LMOD2Q6P5Q4 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
LMOD2Q6P5Q4 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC41.9■■■■■ 4.3
LMOD2Q6P5Q4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC41.85■■■■■ 4.29
LMOD2Q6P5Q4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
LMOD2Q6P5Q4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.84■■■■■ 4.29
LMOD2Q6P5Q4 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
LMOD2Q6P5Q4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
LMOD2Q6P5Q4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
LMOD2Q6P5Q4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC41.77■■■■■ 4.28
LMOD2Q6P5Q4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC41.67■■■■■ 4.26
LMOD2Q6P5Q4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC41.64■■■■■ 4.26
LMOD2Q6P5Q4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
LMOD2Q6P5Q4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
LMOD2Q6P5Q4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC41.55■■■■■ 4.24
LMOD2Q6P5Q4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
LMOD2Q6P5Q4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC41.42■■■■■ 4.22
LMOD2Q6P5Q4 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
LMOD2Q6P5Q4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.38■■■■■ 4.21
LMOD2Q6P5Q4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.34■■■■■ 4.21
LMOD2Q6P5Q4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.32■■■■■ 4.21
LMOD2Q6P5Q4 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
LMOD2Q6P5Q4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC41.25■■■■■ 4.19
LMOD2Q6P5Q4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.19
LMOD2Q6P5Q4 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC41.19■■■■■ 4.19
LMOD2Q6P5Q4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC41.19■■■■■ 4.18
LMOD2Q6P5Q4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
LMOD2Q6P5Q4 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
LMOD2Q6P5Q4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
LMOD2Q6P5Q4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
LMOD2Q6P5Q4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
LMOD2Q6P5Q4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
LMOD2Q6P5Q4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC41.07■■■■■ 4.17
LMOD2Q6P5Q4 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
LMOD2Q6P5Q4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC41.01■■■■■ 4.16
LMOD2Q6P5Q4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
LMOD2Q6P5Q4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC40.93■■■■■ 4.14
LMOD2Q6P5Q4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC40.9■■■■■ 4.14
LMOD2Q6P5Q4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC40.89■■■■■ 4.14
LMOD2Q6P5Q4 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.14
LMOD2Q6P5Q4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
LMOD2Q6P5Q4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
LMOD2Q6P5Q4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
LMOD2Q6P5Q4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
LMOD2Q6P5Q4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC40.81■■■■■ 4.12
LMOD2Q6P5Q4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC40.75■■■■■ 4.11
LMOD2Q6P5Q4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC40.71■■■■■ 4.11
LMOD2Q6P5Q4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.64■■■■■ 4.1
LMOD2Q6P5Q4 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.63■■■■■ 4.09
LMOD2Q6P5Q4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC40.59■■■■■ 4.09
LMOD2Q6P5Q4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC40.59■■■■■ 4.09
LMOD2Q6P5Q4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
LMOD2Q6P5Q4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
LMOD2Q6P5Q4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC40.54■■■■■ 4.08
LMOD2Q6P5Q4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
LMOD2Q6P5Q4 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms