Protein–RNA interactions for Protein: Q6IBS0

TWF2, Twinfilin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF2Q6IBS0 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC37.68■■■■□ 3.62
TWF2Q6IBS0 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
TWF2Q6IBS0 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
TWF2Q6IBS0 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
TWF2Q6IBS0 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
TWF2Q6IBS0 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
TWF2Q6IBS0 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
TWF2Q6IBS0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
TWF2Q6IBS0 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
TWF2Q6IBS0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
TWF2Q6IBS0 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
TWF2Q6IBS0 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
TWF2Q6IBS0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
TWF2Q6IBS0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
TWF2Q6IBS0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
TWF2Q6IBS0 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
TWF2Q6IBS0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
TWF2Q6IBS0 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
TWF2Q6IBS0 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
TWF2Q6IBS0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
TWF2Q6IBS0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
TWF2Q6IBS0 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
TWF2Q6IBS0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
TWF2Q6IBS0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
TWF2Q6IBS0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
TWF2Q6IBS0 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
TWF2Q6IBS0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
TWF2Q6IBS0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
TWF2Q6IBS0 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
TWF2Q6IBS0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
TWF2Q6IBS0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
TWF2Q6IBS0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
TWF2Q6IBS0 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
TWF2Q6IBS0 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TWF2Q6IBS0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
TWF2Q6IBS0 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TWF2Q6IBS0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TWF2Q6IBS0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TWF2Q6IBS0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
TWF2Q6IBS0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
TWF2Q6IBS0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TWF2Q6IBS0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
TWF2Q6IBS0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TWF2Q6IBS0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TWF2Q6IBS0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
TWF2Q6IBS0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
TWF2Q6IBS0 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
TWF2Q6IBS0 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.88
TWF2Q6IBS0 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
TWF2Q6IBS0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
TWF2Q6IBS0 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
TWF2Q6IBS0 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
TWF2Q6IBS0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
TWF2Q6IBS0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
TWF2Q6IBS0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
TWF2Q6IBS0 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
TWF2Q6IBS0 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
TWF2Q6IBS0 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
TWF2Q6IBS0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
TWF2Q6IBS0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
TWF2Q6IBS0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
TWF2Q6IBS0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
TWF2Q6IBS0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
TWF2Q6IBS0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.49■■■□□ 2.79
TWF2Q6IBS0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
TWF2Q6IBS0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
TWF2Q6IBS0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TWF2Q6IBS0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
TWF2Q6IBS0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TWF2Q6IBS0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
TWF2Q6IBS0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
TWF2Q6IBS0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
TWF2Q6IBS0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
TWF2Q6IBS0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
TWF2Q6IBS0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
TWF2Q6IBS0 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TWF2Q6IBS0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TWF2Q6IBS0 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TWF2Q6IBS0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TWF2Q6IBS0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TWF2Q6IBS0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TWF2Q6IBS0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TWF2Q6IBS0 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
TWF2Q6IBS0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TWF2Q6IBS0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TWF2Q6IBS0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TWF2Q6IBS0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TWF2Q6IBS0 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TWF2Q6IBS0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TWF2Q6IBS0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
TWF2Q6IBS0 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
TWF2Q6IBS0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
TWF2Q6IBS0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
TWF2Q6IBS0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
TWF2Q6IBS0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
TWF2Q6IBS0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
TWF2Q6IBS0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
TWF2Q6IBS0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
TWF2Q6IBS0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
TWF2Q6IBS0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms