Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC55.96■■■■■ 6.55
CARMIL2Q6F5E8 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC55.88■■■■■ 6.54
CARMIL2Q6F5E8 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC55.11■■■■■ 6.41
CARMIL2Q6F5E8 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.69■■■■■ 6.35
CARMIL2Q6F5E8 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.11■■■■■ 6.25
CARMIL2Q6F5E8 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC53.65■■■■■ 6.18
CARMIL2Q6F5E8 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC53.38■■■■■ 6.14
CARMIL2Q6F5E8 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.26■■■■■ 6.12
CARMIL2Q6F5E8 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC53.24■■■■■ 6.11
CARMIL2Q6F5E8 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC53.16■■■■■ 6.1
CARMIL2Q6F5E8 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC53.12■■■■■ 6.09
CARMIL2Q6F5E8 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC52.92■■■■■ 6.06
CARMIL2Q6F5E8 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC52.89■■■■■ 6.06
CARMIL2Q6F5E8 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC52.84■■■■■ 6.05
CARMIL2Q6F5E8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.54■■■■■ 6
CARMIL2Q6F5E8 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.41■■■■■ 5.98
CARMIL2Q6F5E8 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC52.18■■■■■ 5.94
CARMIL2Q6F5E8 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC52.1■■■■■ 5.93
CARMIL2Q6F5E8 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC51.95■■■■■ 5.91
CARMIL2Q6F5E8 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.67■■■■■ 5.86
CARMIL2Q6F5E8 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC51.67■■■■■ 5.86
CARMIL2Q6F5E8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC51.58■■■■■ 5.85
CARMIL2Q6F5E8 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC51.56■■■■■ 5.85
CARMIL2Q6F5E8 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.49■■■■■ 5.83
CARMIL2Q6F5E8 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.46■■■■■ 5.83
CARMIL2Q6F5E8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.46■■■■■ 5.83
CARMIL2Q6F5E8 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.27■■■■■ 5.8
CARMIL2Q6F5E8 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC51.2■■■■■ 5.79
CARMIL2Q6F5E8 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC51.08■■■■■ 5.77
CARMIL2Q6F5E8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC50.97■■■■■ 5.75
CARMIL2Q6F5E8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC50.96■■■■■ 5.75
CARMIL2Q6F5E8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC50.85■■■■■ 5.73
CARMIL2Q6F5E8 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.84■■■■■ 5.73
CARMIL2Q6F5E8 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC50.6■■■■■ 5.69
CARMIL2Q6F5E8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC50.52■■■■■ 5.68
CARMIL2Q6F5E8 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC50.43■■■■■ 5.66
CARMIL2Q6F5E8 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC50.41■■■■■ 5.66
CARMIL2Q6F5E8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.37■■■■■ 5.65
CARMIL2Q6F5E8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC50.25■■■■■ 5.63
CARMIL2Q6F5E8 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.17■■■■■ 5.62
CARMIL2Q6F5E8 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC49.77■■■■■ 5.56
CARMIL2Q6F5E8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC49.72■■■■■ 5.55
CARMIL2Q6F5E8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC49.55■■■■■ 5.52
CARMIL2Q6F5E8 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49.51■■■■■ 5.52
CARMIL2Q6F5E8 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.33■■■■■ 5.49
CARMIL2Q6F5E8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC49.33■■■■■ 5.49
CARMIL2Q6F5E8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.31■■■■■ 5.48
CARMIL2Q6F5E8 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC49.3■■■■■ 5.48
CARMIL2Q6F5E8 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC49.3■■■■■ 5.48
CARMIL2Q6F5E8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC49.29■■■■■ 5.48
CARMIL2Q6F5E8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.26■■■■■ 5.48
CARMIL2Q6F5E8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC49.17■■■■■ 5.46
CARMIL2Q6F5E8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC49.17■■■■■ 5.46
CARMIL2Q6F5E8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC49.16■■■■■ 5.46
CARMIL2Q6F5E8 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.15■■■■■ 5.46
CARMIL2Q6F5E8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC49.07■■■■■ 5.45
CARMIL2Q6F5E8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC49.05■■■■■ 5.44
CARMIL2Q6F5E8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC49.04■■■■■ 5.44
CARMIL2Q6F5E8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC49.02■■■■■ 5.44
CARMIL2Q6F5E8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC49■■■■■ 5.43
CARMIL2Q6F5E8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC48.84■■■■■ 5.41
CARMIL2Q6F5E8 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.82■■■■■ 5.41
CARMIL2Q6F5E8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC48.72■■■■■ 5.39
CARMIL2Q6F5E8 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.71■■■■■ 5.39
CARMIL2Q6F5E8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.71■■■■■ 5.39
CARMIL2Q6F5E8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC48.69■■■■■ 5.39
CARMIL2Q6F5E8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.64■■■■■ 5.38
CARMIL2Q6F5E8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC48.64■■■■■ 5.38
CARMIL2Q6F5E8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.5■■■■■ 5.35
CARMIL2Q6F5E8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.5■■■■■ 5.35
CARMIL2Q6F5E8 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC48.47■■■■■ 5.35
CARMIL2Q6F5E8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.46■■■■■ 5.35
CARMIL2Q6F5E8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC48.44■■■■■ 5.35
CARMIL2Q6F5E8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.43■■■■■ 5.34
CARMIL2Q6F5E8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC48.35■■■■■ 5.33
CARMIL2Q6F5E8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.33■■■■■ 5.33
CARMIL2Q6F5E8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC48.33■■■■■ 5.33
CARMIL2Q6F5E8 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.29■■■■■ 5.32
CARMIL2Q6F5E8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC48.27■■■■■ 5.32
CARMIL2Q6F5E8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC48.23■■■■■ 5.31
CARMIL2Q6F5E8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC48.23■■■■■ 5.31
CARMIL2Q6F5E8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.23■■■■■ 5.31
CARMIL2Q6F5E8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.17■■■■■ 5.3
CARMIL2Q6F5E8 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC48.15■■■■■ 5.3
CARMIL2Q6F5E8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC48.15■■■■■ 5.3
CARMIL2Q6F5E8 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC48.15■■■■■ 5.3
CARMIL2Q6F5E8 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC48.14■■■■■ 5.3
CARMIL2Q6F5E8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.14■■■■■ 5.3
CARMIL2Q6F5E8 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.09■■■■■ 5.29
CARMIL2Q6F5E8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC47.98■■■■■ 5.27
CARMIL2Q6F5E8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC47.88■■■■■ 5.25
CARMIL2Q6F5E8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC47.87■■■■■ 5.25
CARMIL2Q6F5E8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC47.87■■■■■ 5.25
CARMIL2Q6F5E8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.85■■■■■ 5.25
CARMIL2Q6F5E8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.85■■■■■ 5.25
CARMIL2Q6F5E8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC47.85■■■■■ 5.25
CARMIL2Q6F5E8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.84■■■■■ 5.25
CARMIL2Q6F5E8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC47.81■■■■■ 5.24
CARMIL2Q6F5E8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.78■■■■■ 5.24
CARMIL2Q6F5E8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC47.74■■■■■ 5.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms