Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC47.71■■■■■ 5.23
CARMIL2Q6F5E8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC47.7■■■■■ 5.23
CARMIL2Q6F5E8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC47.65■■■■■ 5.22
CARMIL2Q6F5E8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC47.64■■■■■ 5.22
CARMIL2Q6F5E8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.64■■■■■ 5.22
CARMIL2Q6F5E8 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.6■■■■■ 5.21
CARMIL2Q6F5E8 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.6■■■■■ 5.21
CARMIL2Q6F5E8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.57■■■■■ 5.21
CARMIL2Q6F5E8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC47.56■■■■■ 5.2
CARMIL2Q6F5E8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC47.56■■■■■ 5.2
CARMIL2Q6F5E8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC47.47■■■■■ 5.19
CARMIL2Q6F5E8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC47.46■■■■■ 5.19
CARMIL2Q6F5E8 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.44■■■■■ 5.19
CARMIL2Q6F5E8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC47.44■■■■■ 5.18
CARMIL2Q6F5E8 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC47.43■■■■■ 5.18
CARMIL2Q6F5E8 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC47.38■■■■■ 5.18
CARMIL2Q6F5E8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.38■■■■■ 5.17
CARMIL2Q6F5E8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.37■■■■■ 5.17
CARMIL2Q6F5E8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.32■■■■■ 5.17
CARMIL2Q6F5E8 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC47.25■■■■■ 5.16
CARMIL2Q6F5E8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC47.16■■■■■ 5.14
CARMIL2Q6F5E8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC47.13■■■■■ 5.14
CARMIL2Q6F5E8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC47.12■■■■■ 5.13
CARMIL2Q6F5E8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC47.12■■■■■ 5.13
CARMIL2Q6F5E8 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC47.08■■■■■ 5.13
CARMIL2Q6F5E8 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.07■■■■■ 5.13
CARMIL2Q6F5E8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC47.05■■■■■ 5.12
CARMIL2Q6F5E8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.05■■■■■ 5.12
CARMIL2Q6F5E8 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.04■■■■■ 5.12
CARMIL2Q6F5E8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC46.97■■■■■ 5.11
CARMIL2Q6F5E8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC46.96■■■■■ 5.11
CARMIL2Q6F5E8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC46.96■■■■■ 5.11
CARMIL2Q6F5E8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC46.95■■■■■ 5.11
CARMIL2Q6F5E8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC46.94■■■■■ 5.1
CARMIL2Q6F5E8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.88■■■■■ 5.1
CARMIL2Q6F5E8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.88■■■■■ 5.1
CARMIL2Q6F5E8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC46.84■■■■■ 5.09
CARMIL2Q6F5E8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.83■■■■■ 5.09
CARMIL2Q6F5E8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.83■■■■■ 5.09
CARMIL2Q6F5E8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC46.79■■■■■ 5.08
CARMIL2Q6F5E8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC46.76■■■■■ 5.08
CARMIL2Q6F5E8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC46.75■■■■■ 5.07
CARMIL2Q6F5E8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.75■■■■■ 5.07
CARMIL2Q6F5E8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.71■■■■■ 5.07
CARMIL2Q6F5E8 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC46.71■■■■■ 5.07
CARMIL2Q6F5E8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC46.7■■■■■ 5.07
CARMIL2Q6F5E8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC46.68■■■■■ 5.06
CARMIL2Q6F5E8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC46.67■■■■■ 5.06
CARMIL2Q6F5E8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC46.65■■■■■ 5.06
CARMIL2Q6F5E8 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.57■■■■■ 5.05
CARMIL2Q6F5E8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.57■■■■■ 5.05
CARMIL2Q6F5E8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC46.57■■■■■ 5.05
CARMIL2Q6F5E8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.57■■■■■ 5.04
CARMIL2Q6F5E8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC46.56■■■■■ 5.04
CARMIL2Q6F5E8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC46.55■■■■■ 5.04
CARMIL2Q6F5E8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.55■■■■■ 5.04
CARMIL2Q6F5E8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.52■■■■■ 5.04
CARMIL2Q6F5E8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC46.5■■■■■ 5.03
CARMIL2Q6F5E8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC46.44■■■■■ 5.02
CARMIL2Q6F5E8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC46.43■■■■■ 5.02
CARMIL2Q6F5E8 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC46.24■■■■■ 4.99
CARMIL2Q6F5E8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.23■■■■■ 4.99
CARMIL2Q6F5E8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.23■■■■■ 4.99
CARMIL2Q6F5E8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC46.22■■■■■ 4.99
CARMIL2Q6F5E8 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.19■■■■■ 4.98
CARMIL2Q6F5E8 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.18■■■■■ 4.98
CARMIL2Q6F5E8 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC46.18■■■■■ 4.98
CARMIL2Q6F5E8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC46.18■■■■■ 4.98
CARMIL2Q6F5E8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC46.13■■■■■ 4.98
CARMIL2Q6F5E8 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.11■■■■■ 4.97
CARMIL2Q6F5E8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC46.11■■■■■ 4.97
CARMIL2Q6F5E8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC46.08■■■■■ 4.97
CARMIL2Q6F5E8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.07■■■■■ 4.96
CARMIL2Q6F5E8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC46.05■■■■■ 4.96
CARMIL2Q6F5E8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.04■■■■■ 4.96
CARMIL2Q6F5E8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC46.04■■■■■ 4.96
CARMIL2Q6F5E8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.04■■■■■ 4.96
CARMIL2Q6F5E8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC46.03■■■■■ 4.96
CARMIL2Q6F5E8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC46.03■■■■■ 4.96
CARMIL2Q6F5E8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.01■■■■■ 4.96
CARMIL2Q6F5E8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC46■■■■■ 4.95
CARMIL2Q6F5E8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC45.98■■■■■ 4.95
CARMIL2Q6F5E8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.94■■■■■ 4.95
CARMIL2Q6F5E8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC45.93■■■■■ 4.94
CARMIL2Q6F5E8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.93■■■■■ 4.94
CARMIL2Q6F5E8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC45.92■■■■■ 4.94
CARMIL2Q6F5E8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.9■■■■■ 4.94
CARMIL2Q6F5E8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.88■■■■■ 4.94
CARMIL2Q6F5E8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.87■■■■■ 4.93
CARMIL2Q6F5E8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC45.87■■■■■ 4.93
CARMIL2Q6F5E8 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC45.87■■■■■ 4.93
CARMIL2Q6F5E8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.86■■■■■ 4.93
CARMIL2Q6F5E8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.77■■■■■ 4.92
CARMIL2Q6F5E8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC45.77■■■■■ 4.92
CARMIL2Q6F5E8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC45.77■■■■■ 4.92
CARMIL2Q6F5E8 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC45.75■■■■■ 4.91
CARMIL2Q6F5E8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC45.74■■■■■ 4.91
CARMIL2Q6F5E8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC45.74■■■■■ 4.91
CARMIL2Q6F5E8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.72■■■■■ 4.91
CARMIL2Q6F5E8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC45.71■■■■■ 4.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms