Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC39.14■■■■□ 3.86
LHX8Q68G74 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC38.99■■■■□ 3.83
LHX8Q68G74 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.49■■■■□ 3.75
LHX8Q68G74 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
LHX8Q68G74 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
LHX8Q68G74 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.59
LHX8Q68G74 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
LHX8Q68G74 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
LHX8Q68G74 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
LHX8Q68G74 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
LHX8Q68G74 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC37.12■■■■□ 3.53
LHX8Q68G74 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
LHX8Q68G74 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
LHX8Q68G74 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC36.9■■■■□ 3.5
LHX8Q68G74 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
LHX8Q68G74 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
LHX8Q68G74 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
LHX8Q68G74 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
LHX8Q68G74 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
LHX8Q68G74 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
LHX8Q68G74 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
LHX8Q68G74 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
LHX8Q68G74 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
LHX8Q68G74 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
LHX8Q68G74 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
LHX8Q68G74 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
LHX8Q68G74 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
LHX8Q68G74 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
LHX8Q68G74 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
LHX8Q68G74 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
LHX8Q68G74 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
LHX8Q68G74 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
LHX8Q68G74 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
LHX8Q68G74 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
LHX8Q68G74 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
LHX8Q68G74 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
LHX8Q68G74 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
LHX8Q68G74 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
LHX8Q68G74 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
LHX8Q68G74 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
LHX8Q68G74 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
LHX8Q68G74 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
LHX8Q68G74 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
LHX8Q68G74 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
LHX8Q68G74 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
LHX8Q68G74 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
LHX8Q68G74 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
LHX8Q68G74 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
LHX8Q68G74 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
LHX8Q68G74 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
LHX8Q68G74 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
LHX8Q68G74 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
LHX8Q68G74 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
LHX8Q68G74 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
LHX8Q68G74 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
LHX8Q68G74 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
LHX8Q68G74 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
LHX8Q68G74 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
LHX8Q68G74 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
LHX8Q68G74 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
LHX8Q68G74 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
LHX8Q68G74 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
LHX8Q68G74 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
LHX8Q68G74 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
LHX8Q68G74 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
LHX8Q68G74 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
LHX8Q68G74 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
LHX8Q68G74 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
LHX8Q68G74 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
LHX8Q68G74 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
LHX8Q68G74 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
LHX8Q68G74 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
LHX8Q68G74 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
LHX8Q68G74 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
LHX8Q68G74 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
LHX8Q68G74 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
LHX8Q68G74 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
LHX8Q68G74 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
LHX8Q68G74 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
LHX8Q68G74 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
LHX8Q68G74 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
LHX8Q68G74 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
LHX8Q68G74 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
LHX8Q68G74 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
LHX8Q68G74 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.62■■■□□ 2.97
LHX8Q68G74 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
LHX8Q68G74 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
LHX8Q68G74 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
LHX8Q68G74 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
LHX8Q68G74 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
LHX8Q68G74 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
LHX8Q68G74 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
LHX8Q68G74 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
LHX8Q68G74 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
LHX8Q68G74 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
LHX8Q68G74 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
LHX8Q68G74 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
LHX8Q68G74 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
LHX8Q68G74 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
LHX8Q68G74 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms