Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYP0

SPATA31A3, Spermatogenesis-associated protein 31A3, humanhuman

Predictions only

Length 1,347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA31A3Q5VYP0 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC47.67■■■■■ 5.22
SPATA31A3Q5VYP0 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC47.58■■■■■ 5.21
SPATA31A3Q5VYP0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC46.96■■■■■ 5.11
SPATA31A3Q5VYP0 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.57■■■■■ 5.05
SPATA31A3Q5VYP0 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.05■■■■■ 4.96
SPATA31A3Q5VYP0 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.65■■■■■ 4.9
SPATA31A3Q5VYP0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.49■■■■■ 4.87
SPATA31A3Q5VYP0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.32■■■■■ 4.85
SPATA31A3Q5VYP0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC45.29■■■■■ 4.84
SPATA31A3Q5VYP0 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
SPATA31A3Q5VYP0 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC45.19■■■■■ 4.83
SPATA31A3Q5VYP0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
SPATA31A3Q5VYP0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC45.01■■■■■ 4.8
SPATA31A3Q5VYP0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC45■■■■■ 4.79
SPATA31A3Q5VYP0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
SPATA31A3Q5VYP0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.74
SPATA31A3Q5VYP0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
SPATA31A3Q5VYP0 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.36■■■■■ 4.69
SPATA31A3Q5VYP0 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
SPATA31A3Q5VYP0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.03■■■■■ 4.64
SPATA31A3Q5VYP0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
SPATA31A3Q5VYP0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
SPATA31A3Q5VYP0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC43.95■■■■■ 4.63
SPATA31A3Q5VYP0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
SPATA31A3Q5VYP0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.85■■■■■ 4.61
SPATA31A3Q5VYP0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
SPATA31A3Q5VYP0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC43.72■■■■■ 4.59
SPATA31A3Q5VYP0 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.65■■■■■ 4.58
SPATA31A3Q5VYP0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC43.46■■■■■ 4.55
SPATA31A3Q5VYP0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC43.42■■■■■ 4.54
SPATA31A3Q5VYP0 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC43.33■■■■■ 4.53
SPATA31A3Q5VYP0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC43.29■■■■■ 4.52
SPATA31A3Q5VYP0 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
SPATA31A3Q5VYP0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
SPATA31A3Q5VYP0 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC43.03■■■■■ 4.48
SPATA31A3Q5VYP0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC43■■■■■ 4.47
SPATA31A3Q5VYP0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC42.98■■■■■ 4.47
SPATA31A3Q5VYP0 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC42.82■■■■■ 4.45
SPATA31A3Q5VYP0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
SPATA31A3Q5VYP0 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
SPATA31A3Q5VYP0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC42.38■■■■■ 4.37
SPATA31A3Q5VYP0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC42.37■■■■■ 4.37
SPATA31A3Q5VYP0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
SPATA31A3Q5VYP0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
SPATA31A3Q5VYP0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.14■■■■■ 4.34
SPATA31A3Q5VYP0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
SPATA31A3Q5VYP0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC42.07■■■■■ 4.33
SPATA31A3Q5VYP0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
SPATA31A3Q5VYP0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC41.97■■■■■ 4.31
SPATA31A3Q5VYP0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
SPATA31A3Q5VYP0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
SPATA31A3Q5VYP0 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC41.96■■■■■ 4.31
SPATA31A3Q5VYP0 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
SPATA31A3Q5VYP0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC41.91■■■■■ 4.3
SPATA31A3Q5VYP0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
SPATA31A3Q5VYP0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC41.83■■■■■ 4.29
SPATA31A3Q5VYP0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
SPATA31A3Q5VYP0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.28
SPATA31A3Q5VYP0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC41.77■■■■■ 4.28
SPATA31A3Q5VYP0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC41.76■■■■■ 4.28
SPATA31A3Q5VYP0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.58■■■■■ 4.25
SPATA31A3Q5VYP0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
SPATA31A3Q5VYP0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.53■■■■■ 4.24
SPATA31A3Q5VYP0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.46■■■■■ 4.23
SPATA31A3Q5VYP0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC41.46■■■■■ 4.23
SPATA31A3Q5VYP0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
SPATA31A3Q5VYP0 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
SPATA31A3Q5VYP0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
SPATA31A3Q5VYP0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
SPATA31A3Q5VYP0 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
SPATA31A3Q5VYP0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC41.3■■■■■ 4.2
SPATA31A3Q5VYP0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC41.3■■■■■ 4.2
SPATA31A3Q5VYP0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
SPATA31A3Q5VYP0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC41.23■■■■■ 4.19
SPATA31A3Q5VYP0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
SPATA31A3Q5VYP0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
SPATA31A3Q5VYP0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
SPATA31A3Q5VYP0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
SPATA31A3Q5VYP0 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
SPATA31A3Q5VYP0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC41.14■■■■■ 4.18
SPATA31A3Q5VYP0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC41.09■■■■■ 4.17
SPATA31A3Q5VYP0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
SPATA31A3Q5VYP0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
SPATA31A3Q5VYP0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
SPATA31A3Q5VYP0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC40.99■■■■■ 4.15
SPATA31A3Q5VYP0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC40.97■■■■■ 4.15
SPATA31A3Q5VYP0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC40.94■■■■■ 4.15
SPATA31A3Q5VYP0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
SPATA31A3Q5VYP0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
SPATA31A3Q5VYP0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC40.89■■■■■ 4.14
SPATA31A3Q5VYP0 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC40.88■■■■■ 4.13
SPATA31A3Q5VYP0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.84■■■■■ 4.13
SPATA31A3Q5VYP0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
SPATA31A3Q5VYP0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC40.78■■■■■ 4.12
SPATA31A3Q5VYP0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC40.78■■■■■ 4.12
SPATA31A3Q5VYP0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
SPATA31A3Q5VYP0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC40.74■■■■■ 4.11
SPATA31A3Q5VYP0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
SPATA31A3Q5VYP0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
SPATA31A3Q5VYP0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms