Protein–RNA interactions for Protein: Q5TCQ9

MAGI3, Membrane-associated guanylate kinase, WW and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGI3Q5TCQ9 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC54.19■■■■■ 6.27
MAGI3Q5TCQ9 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC54.08■■■■■ 6.25
MAGI3Q5TCQ9 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC53.53■■■■■ 6.16
MAGI3Q5TCQ9 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.71■■■■■ 6.03
MAGI3Q5TCQ9 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.32■■■■■ 5.97
MAGI3Q5TCQ9 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC52.14■■■■■ 5.94
MAGI3Q5TCQ9 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.11■■■■■ 5.93
MAGI3Q5TCQ9 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC51.85■■■■■ 5.89
MAGI3Q5TCQ9 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.77■■■■■ 5.88
MAGI3Q5TCQ9 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.67■■■■■ 5.86
MAGI3Q5TCQ9 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC51.57■■■■■ 5.85
MAGI3Q5TCQ9 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC51.48■■■■■ 5.83
MAGI3Q5TCQ9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.43■■■■■ 5.82
MAGI3Q5TCQ9 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC51.15■■■■■ 5.78
MAGI3Q5TCQ9 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC51.04■■■■■ 5.76
MAGI3Q5TCQ9 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.91■■■■■ 5.74
MAGI3Q5TCQ9 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC50.62■■■■■ 5.69
MAGI3Q5TCQ9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC50.52■■■■■ 5.68
MAGI3Q5TCQ9 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC50.45■■■■■ 5.67
MAGI3Q5TCQ9 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC50.29■■■■■ 5.64
MAGI3Q5TCQ9 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC50.2■■■■■ 5.63
MAGI3Q5TCQ9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.16■■■■■ 5.62
MAGI3Q5TCQ9 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.01■■■■■ 5.6
MAGI3Q5TCQ9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC50.01■■■■■ 5.6
MAGI3Q5TCQ9 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC49.92■■■■■ 5.58
MAGI3Q5TCQ9 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC49.91■■■■■ 5.58
MAGI3Q5TCQ9 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.81■■■■■ 5.56
MAGI3Q5TCQ9 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.79■■■■■ 5.56
MAGI3Q5TCQ9 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.73■■■■■ 5.55
MAGI3Q5TCQ9 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.67■■■■■ 5.54
MAGI3Q5TCQ9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC49.65■■■■■ 5.54
MAGI3Q5TCQ9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC49.57■■■■■ 5.53
MAGI3Q5TCQ9 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC49.56■■■■■ 5.52
MAGI3Q5TCQ9 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC49.51■■■■■ 5.52
MAGI3Q5TCQ9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC49.38■■■■■ 5.5
MAGI3Q5TCQ9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.1■■■■■ 5.45
MAGI3Q5TCQ9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC48.9■■■■■ 5.42
MAGI3Q5TCQ9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC48.78■■■■■ 5.4
MAGI3Q5TCQ9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC48.76■■■■■ 5.4
MAGI3Q5TCQ9 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.64■■■■■ 5.38
MAGI3Q5TCQ9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC48.43■■■■■ 5.34
MAGI3Q5TCQ9 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC48.29■■■■■ 5.32
MAGI3Q5TCQ9 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC48.28■■■■■ 5.32
MAGI3Q5TCQ9 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC48.27■■■■■ 5.32
MAGI3Q5TCQ9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.18■■■■■ 5.3
MAGI3Q5TCQ9 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.13■■■■■ 5.3
MAGI3Q5TCQ9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC48.02■■■■■ 5.28
MAGI3Q5TCQ9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC47.99■■■■■ 5.27
MAGI3Q5TCQ9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC47.89■■■■■ 5.26
MAGI3Q5TCQ9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.83■■■■■ 5.25
MAGI3Q5TCQ9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC47.83■■■■■ 5.25
MAGI3Q5TCQ9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC47.83■■■■■ 5.25
MAGI3Q5TCQ9 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.83■■■■■ 5.25
MAGI3Q5TCQ9 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.82■■■■■ 5.25
MAGI3Q5TCQ9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC47.75■■■■■ 5.23
MAGI3Q5TCQ9 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.72■■■■■ 5.23
MAGI3Q5TCQ9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC47.7■■■■■ 5.23
MAGI3Q5TCQ9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC47.67■■■■■ 5.22
MAGI3Q5TCQ9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC47.64■■■■■ 5.22
MAGI3Q5TCQ9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC47.59■■■■■ 5.21
MAGI3Q5TCQ9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC47.52■■■■■ 5.2
MAGI3Q5TCQ9 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC47.52■■■■■ 5.2
MAGI3Q5TCQ9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC47.51■■■■■ 5.2
MAGI3Q5TCQ9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.49■■■■■ 5.19
MAGI3Q5TCQ9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.34■■■■■ 5.17
MAGI3Q5TCQ9 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.33■■■■■ 5.17
MAGI3Q5TCQ9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC47.25■■■■■ 5.16
MAGI3Q5TCQ9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.21■■■■■ 5.15
MAGI3Q5TCQ9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC47.19■■■■■ 5.14
MAGI3Q5TCQ9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.18■■■■■ 5.14
MAGI3Q5TCQ9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC47.15■■■■■ 5.14
MAGI3Q5TCQ9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC47.08■■■■■ 5.13
MAGI3Q5TCQ9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.04■■■■■ 5.12
MAGI3Q5TCQ9 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47■■■■■ 5.11
MAGI3Q5TCQ9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC46.93■■■■■ 5.1
MAGI3Q5TCQ9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.92■■■■■ 5.1
MAGI3Q5TCQ9 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC46.85■■■■■ 5.09
MAGI3Q5TCQ9 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC46.84■■■■■ 5.09
MAGI3Q5TCQ9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC46.83■■■■■ 5.09
MAGI3Q5TCQ9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.82■■■■■ 5.09
MAGI3Q5TCQ9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC46.82■■■■■ 5.09
MAGI3Q5TCQ9 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC46.82■■■■■ 5.09
MAGI3Q5TCQ9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC46.75■■■■■ 5.07
MAGI3Q5TCQ9 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.74■■■■■ 5.07
MAGI3Q5TCQ9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC46.73■■■■■ 5.07
MAGI3Q5TCQ9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC46.72■■■■■ 5.07
MAGI3Q5TCQ9 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC46.71■■■■■ 5.07
MAGI3Q5TCQ9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.71■■■■■ 5.07
MAGI3Q5TCQ9 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC46.71■■■■■ 5.07
MAGI3Q5TCQ9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.68■■■■■ 5.06
MAGI3Q5TCQ9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.65■■■■■ 5.06
MAGI3Q5TCQ9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.64■■■■■ 5.06
MAGI3Q5TCQ9 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC46.63■■■■■ 5.05
MAGI3Q5TCQ9 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.6■■■■■ 5.05
MAGI3Q5TCQ9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC46.57■■■■■ 5.05
MAGI3Q5TCQ9 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.56■■■■■ 5.04
MAGI3Q5TCQ9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC46.54■■■■■ 5.04
MAGI3Q5TCQ9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC46.52■■■■■ 5.04
MAGI3Q5TCQ9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC46.51■■■■■ 5.04
MAGI3Q5TCQ9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC46.49■■■■■ 5.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms