Protein–RNA interactions for Protein: Q5T890

ERCC6L2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6L2Q5T890 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC56.62■■■■■ 6.65
ERCC6L2Q5T890 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC56.26■■■■■ 6.6
ERCC6L2Q5T890 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC56.04■■■■■ 6.56
ERCC6L2Q5T890 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.08■■■■■ 6.41
ERCC6L2Q5T890 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.38■■■■■ 6.3
ERCC6L2Q5T890 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC54.34■■■■■ 6.29
ERCC6L2Q5T890 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC54.12■■■■■ 6.25
ERCC6L2Q5T890 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC54.08■■■■■ 6.25
ERCC6L2Q5T890 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC53.99■■■■■ 6.23
ERCC6L2Q5T890 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.95■■■■■ 6.23
ERCC6L2Q5T890 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC53.74■■■■■ 6.19
ERCC6L2Q5T890 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC53.62■■■■■ 6.17
ERCC6L2Q5T890 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC53.47■■■■■ 6.15
ERCC6L2Q5T890 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.3■■■■■ 6.12
ERCC6L2Q5T890 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.19■■■■■ 6.11
ERCC6L2Q5T890 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC53.15■■■■■ 6.1
ERCC6L2Q5T890 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC53.07■■■■■ 6.09
ERCC6L2Q5T890 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.68■■■■■ 6.02
ERCC6L2Q5T890 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC52.58■■■■■ 6.01
ERCC6L2Q5T890 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.43■■■■■ 5.98
ERCC6L2Q5T890 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC52.43■■■■■ 5.98
ERCC6L2Q5T890 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC52.38■■■■■ 5.98
ERCC6L2Q5T890 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC52.28■■■■■ 5.96
ERCC6L2Q5T890 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.16■■■■■ 5.94
ERCC6L2Q5T890 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC52.04■■■■■ 5.92
ERCC6L2Q5T890 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC52■■■■■ 5.92
ERCC6L2Q5T890 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC51.98■■■■■ 5.91
ERCC6L2Q5T890 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC51.96■■■■■ 5.91
ERCC6L2Q5T890 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC51.83■■■■■ 5.89
ERCC6L2Q5T890 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC51.76■■■■■ 5.88
ERCC6L2Q5T890 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.71■■■■■ 5.87
ERCC6L2Q5T890 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.62■■■■■ 5.85
ERCC6L2Q5T890 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC51.17■■■■■ 5.78
ERCC6L2Q5T890 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC51.06■■■■■ 5.77
ERCC6L2Q5T890 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC51.01■■■■■ 5.76
ERCC6L2Q5T890 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.83■■■■■ 5.73
ERCC6L2Q5T890 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC50.79■■■■■ 5.72
ERCC6L2Q5T890 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50.6■■■■■ 5.69
ERCC6L2Q5T890 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC50.55■■■■■ 5.68
ERCC6L2Q5T890 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC50.4■■■■■ 5.66
ERCC6L2Q5T890 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC50.38■■■■■ 5.66
ERCC6L2Q5T890 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC50.3■■■■■ 5.64
ERCC6L2Q5T890 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.26■■■■■ 5.64
ERCC6L2Q5T890 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC50.25■■■■■ 5.64
ERCC6L2Q5T890 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC50.19■■■■■ 5.63
ERCC6L2Q5T890 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC50.19■■■■■ 5.63
ERCC6L2Q5T890 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC50.17■■■■■ 5.62
ERCC6L2Q5T890 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC50.1■■■■■ 5.61
ERCC6L2Q5T890 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC50.05■■■■■ 5.6
ERCC6L2Q5T890 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC50.01■■■■■ 5.6
ERCC6L2Q5T890 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC50■■■■■ 5.59
ERCC6L2Q5T890 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC49.97■■■■■ 5.59
ERCC6L2Q5T890 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC49.96■■■■■ 5.59
ERCC6L2Q5T890 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC49.95■■■■■ 5.59
ERCC6L2Q5T890 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.94■■■■■ 5.59
ERCC6L2Q5T890 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC49.82■■■■■ 5.57
ERCC6L2Q5T890 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49.8■■■■■ 5.56
ERCC6L2Q5T890 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC49.79■■■■■ 5.56
ERCC6L2Q5T890 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.72■■■■■ 5.55
ERCC6L2Q5T890 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC49.71■■■■■ 5.55
ERCC6L2Q5T890 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC49.7■■■■■ 5.55
ERCC6L2Q5T890 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC49.66■■■■■ 5.54
ERCC6L2Q5T890 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.63■■■■■ 5.53
ERCC6L2Q5T890 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.5■■■■■ 5.51
ERCC6L2Q5T890 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.41■■■■■ 5.5
ERCC6L2Q5T890 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.39■■■■■ 5.5
ERCC6L2Q5T890 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC49.34■■■■■ 5.49
ERCC6L2Q5T890 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC49.26■■■■■ 5.48
ERCC6L2Q5T890 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC49.23■■■■■ 5.47
ERCC6L2Q5T890 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC49.2■■■■■ 5.47
ERCC6L2Q5T890 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC49.18■■■■■ 5.46
ERCC6L2Q5T890 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.14■■■■■ 5.46
ERCC6L2Q5T890 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC49.14■■■■■ 5.46
ERCC6L2Q5T890 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.11■■■■■ 5.45
ERCC6L2Q5T890 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC49.11■■■■■ 5.45
ERCC6L2Q5T890 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.08■■■■■ 5.45
ERCC6L2Q5T890 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC49.07■■■■■ 5.45
ERCC6L2Q5T890 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.06■■■■■ 5.44
ERCC6L2Q5T890 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.98■■■■■ 5.43
ERCC6L2Q5T890 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC48.94■■■■■ 5.43
ERCC6L2Q5T890 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.9■■■■■ 5.42
ERCC6L2Q5T890 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.88■■■■■ 5.42
ERCC6L2Q5T890 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC48.82■■■■■ 5.41
ERCC6L2Q5T890 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.81■■■■■ 5.4
ERCC6L2Q5T890 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC48.8■■■■■ 5.4
ERCC6L2Q5T890 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC48.78■■■■■ 5.4
ERCC6L2Q5T890 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC48.78■■■■■ 5.4
ERCC6L2Q5T890 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC48.78■■■■■ 5.4
ERCC6L2Q5T890 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC48.75■■■■■ 5.39
ERCC6L2Q5T890 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC48.75■■■■■ 5.39
ERCC6L2Q5T890 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC48.74■■■■■ 5.39
ERCC6L2Q5T890 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC48.71■■■■■ 5.39
ERCC6L2Q5T890 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.71■■■■■ 5.39
ERCC6L2Q5T890 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC48.7■■■■■ 5.39
ERCC6L2Q5T890 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC48.68■■■■■ 5.38
ERCC6L2Q5T890 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.67■■■■■ 5.38
ERCC6L2Q5T890 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC48.67■■■■■ 5.38
ERCC6L2Q5T890 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC48.54■■■■■ 5.36
ERCC6L2Q5T890 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.53■■■■■ 5.36
ERCC6L2Q5T890 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC48.52■■■■■ 5.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms