Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC35.54■■■■□ 3.28
BRMS1LQ5PSV4 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
BRMS1LQ5PSV4 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
BRMS1LQ5PSV4 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
BRMS1LQ5PSV4 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
BRMS1LQ5PSV4 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
BRMS1LQ5PSV4 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
BRMS1LQ5PSV4 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
BRMS1LQ5PSV4 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
BRMS1LQ5PSV4 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
BRMS1LQ5PSV4 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
BRMS1LQ5PSV4 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
BRMS1LQ5PSV4 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
BRMS1LQ5PSV4 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
BRMS1LQ5PSV4 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
BRMS1LQ5PSV4 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
BRMS1LQ5PSV4 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
BRMS1LQ5PSV4 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
BRMS1LQ5PSV4 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
BRMS1LQ5PSV4 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
BRMS1LQ5PSV4 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
BRMS1LQ5PSV4 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
BRMS1LQ5PSV4 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
BRMS1LQ5PSV4 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
BRMS1LQ5PSV4 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
BRMS1LQ5PSV4 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
BRMS1LQ5PSV4 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
BRMS1LQ5PSV4 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.98■■■□□ 2.71
BRMS1LQ5PSV4 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
BRMS1LQ5PSV4 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
BRMS1LQ5PSV4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
BRMS1LQ5PSV4 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
BRMS1LQ5PSV4 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
BRMS1LQ5PSV4 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
BRMS1LQ5PSV4 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
BRMS1LQ5PSV4 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
BRMS1LQ5PSV4 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
BRMS1LQ5PSV4 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
BRMS1LQ5PSV4 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
BRMS1LQ5PSV4 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
BRMS1LQ5PSV4 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
BRMS1LQ5PSV4 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
BRMS1LQ5PSV4 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
BRMS1LQ5PSV4 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
BRMS1LQ5PSV4 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
BRMS1LQ5PSV4 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
BRMS1LQ5PSV4 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
BRMS1LQ5PSV4 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
BRMS1LQ5PSV4 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
BRMS1LQ5PSV4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
BRMS1LQ5PSV4 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
BRMS1LQ5PSV4 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
BRMS1LQ5PSV4 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
BRMS1LQ5PSV4 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
BRMS1LQ5PSV4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
BRMS1LQ5PSV4 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
BRMS1LQ5PSV4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
BRMS1LQ5PSV4 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
BRMS1LQ5PSV4 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
BRMS1LQ5PSV4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
BRMS1LQ5PSV4 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
BRMS1LQ5PSV4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
BRMS1LQ5PSV4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
BRMS1LQ5PSV4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
BRMS1LQ5PSV4 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
BRMS1LQ5PSV4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
BRMS1LQ5PSV4 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
BRMS1LQ5PSV4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.65■■■□□ 2.5
BRMS1LQ5PSV4 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
BRMS1LQ5PSV4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
BRMS1LQ5PSV4 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
BRMS1LQ5PSV4 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
BRMS1LQ5PSV4 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
BRMS1LQ5PSV4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
BRMS1LQ5PSV4 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
BRMS1LQ5PSV4 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
BRMS1LQ5PSV4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
BRMS1LQ5PSV4 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
BRMS1LQ5PSV4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
BRMS1LQ5PSV4 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
BRMS1LQ5PSV4 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
BRMS1LQ5PSV4 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
BRMS1LQ5PSV4 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
BRMS1LQ5PSV4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
BRMS1LQ5PSV4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
BRMS1LQ5PSV4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
BRMS1LQ5PSV4 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
BRMS1LQ5PSV4 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
BRMS1LQ5PSV4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
BRMS1LQ5PSV4 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
BRMS1LQ5PSV4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
BRMS1LQ5PSV4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
BRMS1LQ5PSV4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
BRMS1LQ5PSV4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
BRMS1LQ5PSV4 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
BRMS1LQ5PSV4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
BRMS1LQ5PSV4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
BRMS1LQ5PSV4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
BRMS1LQ5PSV4 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
BRMS1LQ5PSV4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms