Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI83

KRTAP24-1, Keratin-associated protein 24-1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP24-1Q3LI83 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KRTAP24-1Q3LI83 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRTAP24-1Q3LI83 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRTAP24-1Q3LI83 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KRTAP24-1Q3LI83 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRTAP24-1Q3LI83 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRTAP24-1Q3LI83 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRTAP24-1Q3LI83 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRTAP24-1Q3LI83 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRTAP24-1Q3LI83 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRTAP24-1Q3LI83 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRTAP24-1Q3LI83 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRTAP24-1Q3LI83 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRTAP24-1Q3LI83 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRTAP24-1Q3LI83 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRTAP24-1Q3LI83 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
KRTAP24-1Q3LI83 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRTAP24-1Q3LI83 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRTAP24-1Q3LI83 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRTAP24-1Q3LI83 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRTAP24-1Q3LI83 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRTAP24-1Q3LI83 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRTAP24-1Q3LI83 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRTAP24-1Q3LI83 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRTAP24-1Q3LI83 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRTAP24-1Q3LI83 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
KRTAP24-1Q3LI83 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRTAP24-1Q3LI83 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
KRTAP24-1Q3LI83 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRTAP24-1Q3LI83 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRTAP24-1Q3LI83 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRTAP24-1Q3LI83 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRTAP24-1Q3LI83 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRTAP24-1Q3LI83 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRTAP24-1Q3LI83 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
KRTAP24-1Q3LI83 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
KRTAP24-1Q3LI83 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRTAP24-1Q3LI83 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRTAP24-1Q3LI83 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRTAP24-1Q3LI83 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRTAP24-1Q3LI83 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRTAP24-1Q3LI83 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRTAP24-1Q3LI83 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRTAP24-1Q3LI83 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRTAP24-1Q3LI83 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRTAP24-1Q3LI83 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KRTAP24-1Q3LI83 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRTAP24-1Q3LI83 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRTAP24-1Q3LI83 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRTAP24-1Q3LI83 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRTAP24-1Q3LI83 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRTAP24-1Q3LI83 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRTAP24-1Q3LI83 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRTAP24-1Q3LI83 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRTAP24-1Q3LI83 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRTAP24-1Q3LI83 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRTAP24-1Q3LI83 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRTAP24-1Q3LI83 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRTAP24-1Q3LI83 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRTAP24-1Q3LI83 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KRTAP24-1Q3LI83 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRTAP24-1Q3LI83 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRTAP24-1Q3LI83 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRTAP24-1Q3LI83 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRTAP24-1Q3LI83 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRTAP24-1Q3LI83 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRTAP24-1Q3LI83 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRTAP24-1Q3LI83 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRTAP24-1Q3LI83 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRTAP24-1Q3LI83 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRTAP24-1Q3LI83 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRTAP24-1Q3LI83 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRTAP24-1Q3LI83 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRTAP24-1Q3LI83 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRTAP24-1Q3LI83 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KRTAP24-1Q3LI83 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRTAP24-1Q3LI83 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRTAP24-1Q3LI83 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRTAP24-1Q3LI83 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRTAP24-1Q3LI83 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRTAP24-1Q3LI83 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRTAP24-1Q3LI83 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRTAP24-1Q3LI83 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRTAP24-1Q3LI83 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRTAP24-1Q3LI83 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRTAP24-1Q3LI83 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRTAP24-1Q3LI83 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KRTAP24-1Q3LI83 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRTAP24-1Q3LI83 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRTAP24-1Q3LI83 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRTAP24-1Q3LI83 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRTAP24-1Q3LI83 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRTAP24-1Q3LI83 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRTAP24-1Q3LI83 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRTAP24-1Q3LI83 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRTAP24-1Q3LI83 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRTAP24-1Q3LI83 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
KRTAP24-1Q3LI83 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRTAP24-1Q3LI83 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRTAP24-1Q3LI83 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms