Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

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Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
MSMPQ1L6U9 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MSMPQ1L6U9 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MSMPQ1L6U9 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
MSMPQ1L6U9 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MSMPQ1L6U9 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MSMPQ1L6U9 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MSMPQ1L6U9 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MSMPQ1L6U9 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MSMPQ1L6U9 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MSMPQ1L6U9 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MSMPQ1L6U9 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
MSMPQ1L6U9 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
MSMPQ1L6U9 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MSMPQ1L6U9 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MSMPQ1L6U9 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MSMPQ1L6U9 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MSMPQ1L6U9 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MSMPQ1L6U9 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MSMPQ1L6U9 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MSMPQ1L6U9 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MSMPQ1L6U9 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MSMPQ1L6U9 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MSMPQ1L6U9 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MSMPQ1L6U9 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MSMPQ1L6U9 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MSMPQ1L6U9 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MSMPQ1L6U9 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MSMPQ1L6U9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MSMPQ1L6U9 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MSMPQ1L6U9 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MSMPQ1L6U9 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MSMPQ1L6U9 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MSMPQ1L6U9 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MSMPQ1L6U9 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MSMPQ1L6U9 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MSMPQ1L6U9 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MSMPQ1L6U9 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MSMPQ1L6U9 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MSMPQ1L6U9 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MSMPQ1L6U9 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MSMPQ1L6U9 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MSMPQ1L6U9 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MSMPQ1L6U9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MSMPQ1L6U9 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MSMPQ1L6U9 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
MSMPQ1L6U9 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MSMPQ1L6U9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26■■□□□ 1.75
MSMPQ1L6U9 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MSMPQ1L6U9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MSMPQ1L6U9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MSMPQ1L6U9 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MSMPQ1L6U9 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MSMPQ1L6U9 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MSMPQ1L6U9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MSMPQ1L6U9 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MSMPQ1L6U9 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MSMPQ1L6U9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
MSMPQ1L6U9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MSMPQ1L6U9 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MSMPQ1L6U9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
MSMPQ1L6U9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MSMPQ1L6U9 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MSMPQ1L6U9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MSMPQ1L6U9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MSMPQ1L6U9 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MSMPQ1L6U9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MSMPQ1L6U9 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MSMPQ1L6U9 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MSMPQ1L6U9 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MSMPQ1L6U9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MSMPQ1L6U9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MSMPQ1L6U9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MSMPQ1L6U9 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MSMPQ1L6U9 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MSMPQ1L6U9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MSMPQ1L6U9 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MSMPQ1L6U9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MSMPQ1L6U9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MSMPQ1L6U9 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MSMPQ1L6U9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MSMPQ1L6U9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MSMPQ1L6U9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MSMPQ1L6U9 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MSMPQ1L6U9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MSMPQ1L6U9 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MSMPQ1L6U9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MSMPQ1L6U9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MSMPQ1L6U9 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSMPQ1L6U9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MSMPQ1L6U9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MSMPQ1L6U9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
MSMPQ1L6U9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MSMPQ1L6U9 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MSMPQ1L6U9 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MSMPQ1L6U9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MSMPQ1L6U9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MSMPQ1L6U9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MSMPQ1L6U9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MSMPQ1L6U9 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
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