Protein–RNA interactions for Protein: Q16236

NFE2L2, Nuclear factor erythroid 2-related factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L2Q16236 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC45.33■■■■■ 4.85
NFE2L2Q16236 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
NFE2L2Q16236 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.96■■■■■ 4.63
NFE2L2Q16236 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
NFE2L2Q16236 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC43.9■■■■■ 4.62
NFE2L2Q16236 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
NFE2L2Q16236 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC43.78■■■■■ 4.6
NFE2L2Q16236 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC43.03■■■■■ 4.48
NFE2L2Q16236 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.98■■■■■ 4.47
NFE2L2Q16236 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
NFE2L2Q16236 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC42.69■■■■■ 4.42
NFE2L2Q16236 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC42.32■■■■■ 4.36
NFE2L2Q16236 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.3■■■■■ 4.36
NFE2L2Q16236 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC42.16■■■■■ 4.34
NFE2L2Q16236 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.07■■■■■ 4.33
NFE2L2Q16236 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC42.06■■■■■ 4.32
NFE2L2Q16236 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
NFE2L2Q16236 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC41.94■■■■■ 4.3
NFE2L2Q16236 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
NFE2L2Q16236 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC41.72■■■■■ 4.27
NFE2L2Q16236 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.56■■■■■ 4.24
NFE2L2Q16236 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
NFE2L2Q16236 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
NFE2L2Q16236 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
NFE2L2Q16236 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
NFE2L2Q16236 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
NFE2L2Q16236 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
NFE2L2Q16236 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
NFE2L2Q16236 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
NFE2L2Q16236 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
NFE2L2Q16236 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
NFE2L2Q16236 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC40.51■■■■■ 4.08
NFE2L2Q16236 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.49■■■■■ 4.07
NFE2L2Q16236 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
NFE2L2Q16236 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC40.45■■■■■ 4.07
NFE2L2Q16236 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC40.41■■■■■ 4.06
NFE2L2Q16236 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
NFE2L2Q16236 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.21■■■■■ 4.03
NFE2L2Q16236 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.1■■■■■ 4.01
NFE2L2Q16236 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
NFE2L2Q16236 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4
NFE2L2Q16236 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.03■■■■■ 4
NFE2L2Q16236 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
NFE2L2Q16236 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
NFE2L2Q16236 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC40.02■■■■■ 4
NFE2L2Q16236 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
NFE2L2Q16236 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC39.97■■■■□ 3.99
NFE2L2Q16236 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC39.93■■■■□ 3.98
NFE2L2Q16236 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
NFE2L2Q16236 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC39.63■■■■□ 3.93
NFE2L2Q16236 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.6■■■■□ 3.93
NFE2L2Q16236 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC39.59■■■■□ 3.93
NFE2L2Q16236 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
NFE2L2Q16236 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC39.52■■■■□ 3.92
NFE2L2Q16236 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
NFE2L2Q16236 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
NFE2L2Q16236 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC39.48■■■■□ 3.91
NFE2L2Q16236 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC39.45■■■■□ 3.91
NFE2L2Q16236 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC39.33■■■■□ 3.89
NFE2L2Q16236 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
NFE2L2Q16236 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
NFE2L2Q16236 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.22■■■■□ 3.87
NFE2L2Q16236 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
NFE2L2Q16236 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
NFE2L2Q16236 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC39.04■■■■□ 3.84
NFE2L2Q16236 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
NFE2L2Q16236 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
NFE2L2Q16236 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC38.98■■■■□ 3.83
NFE2L2Q16236 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
NFE2L2Q16236 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
NFE2L2Q16236 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
NFE2L2Q16236 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
NFE2L2Q16236 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
NFE2L2Q16236 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
NFE2L2Q16236 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC38.69■■■■□ 3.78
NFE2L2Q16236 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
NFE2L2Q16236 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
NFE2L2Q16236 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
NFE2L2Q16236 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
NFE2L2Q16236 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
NFE2L2Q16236 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
NFE2L2Q16236 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
NFE2L2Q16236 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
NFE2L2Q16236 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
NFE2L2Q16236 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC38.49■■■■□ 3.75
NFE2L2Q16236 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
NFE2L2Q16236 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
NFE2L2Q16236 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
NFE2L2Q16236 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
NFE2L2Q16236 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC38.4■■■■□ 3.74
NFE2L2Q16236 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
NFE2L2Q16236 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
NFE2L2Q16236 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
NFE2L2Q16236 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
NFE2L2Q16236 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
NFE2L2Q16236 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
NFE2L2Q16236 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
NFE2L2Q16236 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
NFE2L2Q16236 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC38.16■■■■□ 3.7
NFE2L2Q16236 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms