Protein–RNA interactions for Protein: Q13113

PDZK1IP1, PDZK1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1IP1Q13113 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PDZK1IP1Q13113 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
PDZK1IP1Q13113 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
PDZK1IP1Q13113 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDZK1IP1Q13113 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDZK1IP1Q13113 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDZK1IP1Q13113 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDZK1IP1Q13113 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDZK1IP1Q13113 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDZK1IP1Q13113 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDZK1IP1Q13113 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDZK1IP1Q13113 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PDZK1IP1Q13113 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDZK1IP1Q13113 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDZK1IP1Q13113 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDZK1IP1Q13113 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PDZK1IP1Q13113 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDZK1IP1Q13113 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDZK1IP1Q13113 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDZK1IP1Q13113 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDZK1IP1Q13113 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDZK1IP1Q13113 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDZK1IP1Q13113 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDZK1IP1Q13113 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDZK1IP1Q13113 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDZK1IP1Q13113 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDZK1IP1Q13113 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDZK1IP1Q13113 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDZK1IP1Q13113 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDZK1IP1Q13113 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDZK1IP1Q13113 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDZK1IP1Q13113 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDZK1IP1Q13113 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDZK1IP1Q13113 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDZK1IP1Q13113 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDZK1IP1Q13113 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDZK1IP1Q13113 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDZK1IP1Q13113 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDZK1IP1Q13113 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDZK1IP1Q13113 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDZK1IP1Q13113 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDZK1IP1Q13113 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDZK1IP1Q13113 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDZK1IP1Q13113 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDZK1IP1Q13113 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDZK1IP1Q13113 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDZK1IP1Q13113 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDZK1IP1Q13113 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDZK1IP1Q13113 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDZK1IP1Q13113 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDZK1IP1Q13113 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDZK1IP1Q13113 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDZK1IP1Q13113 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDZK1IP1Q13113 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDZK1IP1Q13113 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDZK1IP1Q13113 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDZK1IP1Q13113 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDZK1IP1Q13113 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDZK1IP1Q13113 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDZK1IP1Q13113 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDZK1IP1Q13113 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDZK1IP1Q13113 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDZK1IP1Q13113 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDZK1IP1Q13113 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDZK1IP1Q13113 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDZK1IP1Q13113 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDZK1IP1Q13113 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDZK1IP1Q13113 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDZK1IP1Q13113 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDZK1IP1Q13113 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDZK1IP1Q13113 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PDZK1IP1Q13113 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDZK1IP1Q13113 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDZK1IP1Q13113 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDZK1IP1Q13113 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDZK1IP1Q13113 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDZK1IP1Q13113 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDZK1IP1Q13113 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDZK1IP1Q13113 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDZK1IP1Q13113 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDZK1IP1Q13113 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDZK1IP1Q13113 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDZK1IP1Q13113 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDZK1IP1Q13113 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDZK1IP1Q13113 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDZK1IP1Q13113 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDZK1IP1Q13113 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDZK1IP1Q13113 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDZK1IP1Q13113 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PDZK1IP1Q13113 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PDZK1IP1Q13113 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDZK1IP1Q13113 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDZK1IP1Q13113 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDZK1IP1Q13113 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDZK1IP1Q13113 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDZK1IP1Q13113 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDZK1IP1Q13113 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDZK1IP1Q13113 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDZK1IP1Q13113 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PDZK1IP1Q13113 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms