Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC37.65■■■■□ 3.62
STRN3Q13033 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
STRN3Q13033 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
STRN3Q13033 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC36.57■■■■□ 3.45
STRN3Q13033 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
STRN3Q13033 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
STRN3Q13033 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
STRN3Q13033 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
STRN3Q13033 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
STRN3Q13033 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
STRN3Q13033 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
STRN3Q13033 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
STRN3Q13033 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
STRN3Q13033 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
STRN3Q13033 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
STRN3Q13033 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
STRN3Q13033 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
STRN3Q13033 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.16
STRN3Q13033 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
STRN3Q13033 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
STRN3Q13033 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
STRN3Q13033 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
STRN3Q13033 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
STRN3Q13033 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
STRN3Q13033 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
STRN3Q13033 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
STRN3Q13033 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
STRN3Q13033 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
STRN3Q13033 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
STRN3Q13033 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
STRN3Q13033 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
STRN3Q13033 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
STRN3Q13033 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
STRN3Q13033 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
STRN3Q13033 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
STRN3Q13033 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
STRN3Q13033 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
STRN3Q13033 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
STRN3Q13033 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
STRN3Q13033 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
STRN3Q13033 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
STRN3Q13033 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
STRN3Q13033 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
STRN3Q13033 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
STRN3Q13033 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
STRN3Q13033 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
STRN3Q13033 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
STRN3Q13033 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
STRN3Q13033 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
STRN3Q13033 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
STRN3Q13033 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
STRN3Q13033 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
STRN3Q13033 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
STRN3Q13033 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
STRN3Q13033 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
STRN3Q13033 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
STRN3Q13033 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
STRN3Q13033 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
STRN3Q13033 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
STRN3Q13033 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
STRN3Q13033 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
STRN3Q13033 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
STRN3Q13033 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
STRN3Q13033 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
STRN3Q13033 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
STRN3Q13033 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
STRN3Q13033 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
STRN3Q13033 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.51■■■□□ 2.79
STRN3Q13033 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
STRN3Q13033 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
STRN3Q13033 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
STRN3Q13033 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
STRN3Q13033 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
STRN3Q13033 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
STRN3Q13033 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
STRN3Q13033 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
STRN3Q13033 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
STRN3Q13033 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
STRN3Q13033 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
STRN3Q13033 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
STRN3Q13033 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
STRN3Q13033 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
STRN3Q13033 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
STRN3Q13033 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
STRN3Q13033 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
STRN3Q13033 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
STRN3Q13033 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
STRN3Q13033 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
STRN3Q13033 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
STRN3Q13033 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
STRN3Q13033 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
STRN3Q13033 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
STRN3Q13033 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
STRN3Q13033 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
STRN3Q13033 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
STRN3Q13033 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
STRN3Q13033 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
STRN3Q13033 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
STRN3Q13033 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
STRN3Q13033 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.6 ms