Protein–RNA interactions for Protein: Q05066

SRY, Sex-determining region Y protein, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRYQ05066 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SRYQ05066 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SRYQ05066 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SRYQ05066 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SRYQ05066 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SRYQ05066 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SRYQ05066 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
SRYQ05066 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SRYQ05066 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SRYQ05066 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SRYQ05066 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SRYQ05066 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
SRYQ05066 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SRYQ05066 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SRYQ05066 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SRYQ05066 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SRYQ05066 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SRYQ05066 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SRYQ05066 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SRYQ05066 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SRYQ05066 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SRYQ05066 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SRYQ05066 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SRYQ05066 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SRYQ05066 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SRYQ05066 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SRYQ05066 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SRYQ05066 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SRYQ05066 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SRYQ05066 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SRYQ05066 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SRYQ05066 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SRYQ05066 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SRYQ05066 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SRYQ05066 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SRYQ05066 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SRYQ05066 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SRYQ05066 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SRYQ05066 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SRYQ05066 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SRYQ05066 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SRYQ05066 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SRYQ05066 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SRYQ05066 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SRYQ05066 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SRYQ05066 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SRYQ05066 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SRYQ05066 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SRYQ05066 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SRYQ05066 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SRYQ05066 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SRYQ05066 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SRYQ05066 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SRYQ05066 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SRYQ05066 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SRYQ05066 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SRYQ05066 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SRYQ05066 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SRYQ05066 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRYQ05066 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRYQ05066 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SRYQ05066 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SRYQ05066 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SRYQ05066 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SRYQ05066 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SRYQ05066 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SRYQ05066 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SRYQ05066 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SRYQ05066 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SRYQ05066 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SRYQ05066 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SRYQ05066 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SRYQ05066 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SRYQ05066 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SRYQ05066 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SRYQ05066 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SRYQ05066 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SRYQ05066 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SRYQ05066 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SRYQ05066 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SRYQ05066 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SRYQ05066 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SRYQ05066 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SRYQ05066 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SRYQ05066 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SRYQ05066 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SRYQ05066 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SRYQ05066 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SRYQ05066 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SRYQ05066 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SRYQ05066 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SRYQ05066 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SRYQ05066 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SRYQ05066 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SRYQ05066 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SRYQ05066 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SRYQ05066 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRYQ05066 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SRYQ05066 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SRYQ05066 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms