Protein–RNA interactions for Protein: P54259

ATN1, Atrophin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATN1P54259 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC38.68■■■■□ 3.78
ATN1P54259 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC38.55■■■■□ 3.76
ATN1P54259 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.1■■■■□ 3.69
ATN1P54259 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
ATN1P54259 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
ATN1P54259 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
ATN1P54259 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
ATN1P54259 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
ATN1P54259 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC36.83■■■■□ 3.49
ATN1P54259 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
ATN1P54259 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
ATN1P54259 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
ATN1P54259 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
ATN1P54259 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
ATN1P54259 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
ATN1P54259 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
ATN1P54259 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ATN1P54259 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
ATN1P54259 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
ATN1P54259 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
ATN1P54259 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
ATN1P54259 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
ATN1P54259 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
ATN1P54259 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
ATN1P54259 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
ATN1P54259 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
ATN1P54259 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
ATN1P54259 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
ATN1P54259 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
ATN1P54259 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
ATN1P54259 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
ATN1P54259 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
ATN1P54259 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.21
ATN1P54259 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
ATN1P54259 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
ATN1P54259 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
ATN1P54259 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
ATN1P54259 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
ATN1P54259 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
ATN1P54259 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
ATN1P54259 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
ATN1P54259 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
ATN1P54259 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
ATN1P54259 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
ATN1P54259 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ATN1P54259 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ATN1P54259 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ATN1P54259 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ATN1P54259 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
ATN1P54259 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
ATN1P54259 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ATN1P54259 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ATN1P54259 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ATN1P54259 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
ATN1P54259 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
ATN1P54259 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
ATN1P54259 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
ATN1P54259 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
ATN1P54259 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ATN1P54259 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
ATN1P54259 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
ATN1P54259 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
ATN1P54259 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
ATN1P54259 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
ATN1P54259 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ATN1P54259 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ATN1P54259 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
ATN1P54259 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
ATN1P54259 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
ATN1P54259 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC33.57■■■□□ 2.96
ATN1P54259 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
ATN1P54259 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
ATN1P54259 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
ATN1P54259 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
ATN1P54259 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
ATN1P54259 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ATN1P54259 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ATN1P54259 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ATN1P54259 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ATN1P54259 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ATN1P54259 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
ATN1P54259 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
ATN1P54259 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
ATN1P54259 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
ATN1P54259 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
ATN1P54259 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
ATN1P54259 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
ATN1P54259 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
ATN1P54259 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ATN1P54259 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
ATN1P54259 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
ATN1P54259 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
ATN1P54259 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ATN1P54259 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ATN1P54259 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ATN1P54259 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
ATN1P54259 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
ATN1P54259 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
ATN1P54259 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
ATN1P54259 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms