Protein–RNA interactions for Protein: P51159

RAB27A, Ras-related protein Rab-27A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB27AP51159 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC37.58■■■■□ 3.61
RAB27AP51159 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
RAB27AP51159 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
RAB27AP51159 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
RAB27AP51159 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
RAB27AP51159 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
RAB27AP51159 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
RAB27AP51159 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
RAB27AP51159 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
RAB27AP51159 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
RAB27AP51159 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
RAB27AP51159 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
RAB27AP51159 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
RAB27AP51159 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.2
RAB27AP51159 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
RAB27AP51159 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
RAB27AP51159 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
RAB27AP51159 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
RAB27AP51159 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
RAB27AP51159 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
RAB27AP51159 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
RAB27AP51159 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
RAB27AP51159 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
RAB27AP51159 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
RAB27AP51159 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
RAB27AP51159 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
RAB27AP51159 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
RAB27AP51159 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
RAB27AP51159 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
RAB27AP51159 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
RAB27AP51159 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RAB27AP51159 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
RAB27AP51159 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
RAB27AP51159 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
RAB27AP51159 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
RAB27AP51159 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
RAB27AP51159 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
RAB27AP51159 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
RAB27AP51159 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
RAB27AP51159 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
RAB27AP51159 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
RAB27AP51159 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
RAB27AP51159 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
RAB27AP51159 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
RAB27AP51159 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
RAB27AP51159 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
RAB27AP51159 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
RAB27AP51159 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
RAB27AP51159 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
RAB27AP51159 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
RAB27AP51159 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
RAB27AP51159 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
RAB27AP51159 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
RAB27AP51159 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
RAB27AP51159 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
RAB27AP51159 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
RAB27AP51159 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
RAB27AP51159 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
RAB27AP51159 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
RAB27AP51159 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
RAB27AP51159 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
RAB27AP51159 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
RAB27AP51159 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
RAB27AP51159 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
RAB27AP51159 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.39■■■□□ 2.78
RAB27AP51159 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
RAB27AP51159 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.36■■■□□ 2.77
RAB27AP51159 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
RAB27AP51159 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
RAB27AP51159 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
RAB27AP51159 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
RAB27AP51159 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
RAB27AP51159 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
RAB27AP51159 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
RAB27AP51159 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
RAB27AP51159 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
RAB27AP51159 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
RAB27AP51159 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
RAB27AP51159 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
RAB27AP51159 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
RAB27AP51159 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
RAB27AP51159 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
RAB27AP51159 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
RAB27AP51159 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
RAB27AP51159 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
RAB27AP51159 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
RAB27AP51159 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
RAB27AP51159 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
RAB27AP51159 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
RAB27AP51159 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
RAB27AP51159 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
RAB27AP51159 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
RAB27AP51159 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
RAB27AP51159 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
RAB27AP51159 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
RAB27AP51159 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
RAB27AP51159 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
RAB27AP51159 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
RAB27AP51159 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
RAB27AP51159 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms