Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRIP1P50238 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRIP1P50238 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRIP1P50238 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRIP1P50238 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CRIP1P50238 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CRIP1P50238 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CRIP1P50238 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRIP1P50238 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRIP1P50238 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRIP1P50238 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CRIP1P50238 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRIP1P50238 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRIP1P50238 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CRIP1P50238 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRIP1P50238 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRIP1P50238 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRIP1P50238 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRIP1P50238 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRIP1P50238 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRIP1P50238 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRIP1P50238 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRIP1P50238 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRIP1P50238 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRIP1P50238 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRIP1P50238 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRIP1P50238 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRIP1P50238 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRIP1P50238 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRIP1P50238 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRIP1P50238 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRIP1P50238 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRIP1P50238 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRIP1P50238 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRIP1P50238 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRIP1P50238 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRIP1P50238 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRIP1P50238 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRIP1P50238 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CRIP1P50238 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRIP1P50238 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRIP1P50238 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CRIP1P50238 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRIP1P50238 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRIP1P50238 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRIP1P50238 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CRIP1P50238 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRIP1P50238 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRIP1P50238 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRIP1P50238 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRIP1P50238 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRIP1P50238 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRIP1P50238 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRIP1P50238 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRIP1P50238 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRIP1P50238 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRIP1P50238 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRIP1P50238 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRIP1P50238 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRIP1P50238 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRIP1P50238 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRIP1P50238 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRIP1P50238 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRIP1P50238 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRIP1P50238 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRIP1P50238 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRIP1P50238 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRIP1P50238 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRIP1P50238 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRIP1P50238 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRIP1P50238 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRIP1P50238 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRIP1P50238 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRIP1P50238 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRIP1P50238 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRIP1P50238 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRIP1P50238 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRIP1P50238 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CRIP1P50238 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRIP1P50238 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRIP1P50238 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRIP1P50238 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRIP1P50238 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CRIP1P50238 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRIP1P50238 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRIP1P50238 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRIP1P50238 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRIP1P50238 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRIP1P50238 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRIP1P50238 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRIP1P50238 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRIP1P50238 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRIP1P50238 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRIP1P50238 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CRIP1P50238 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CRIP1P50238 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CRIP1P50238 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRIP1P50238 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CRIP1P50238 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CRIP1P50238 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 221.1 ms