Protein–RNA interactions for Protein: P50221

MEOX1, Homeobox protein MOX-1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEOX1P50221 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.41■■■□□ 2.62
MEOX1P50221 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
MEOX1P50221 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
MEOX1P50221 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
MEOX1P50221 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
MEOX1P50221 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
MEOX1P50221 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
MEOX1P50221 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
MEOX1P50221 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
MEOX1P50221 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
MEOX1P50221 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
MEOX1P50221 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
MEOX1P50221 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MEOX1P50221 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
MEOX1P50221 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MEOX1P50221 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MEOX1P50221 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MEOX1P50221 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MEOX1P50221 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MEOX1P50221 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MEOX1P50221 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MEOX1P50221 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MEOX1P50221 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MEOX1P50221 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MEOX1P50221 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MEOX1P50221 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MEOX1P50221 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MEOX1P50221 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MEOX1P50221 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MEOX1P50221 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MEOX1P50221 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MEOX1P50221 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MEOX1P50221 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MEOX1P50221 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MEOX1P50221 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MEOX1P50221 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MEOX1P50221 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MEOX1P50221 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MEOX1P50221 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
MEOX1P50221 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MEOX1P50221 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MEOX1P50221 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MEOX1P50221 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MEOX1P50221 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
MEOX1P50221 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
MEOX1P50221 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MEOX1P50221 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MEOX1P50221 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
MEOX1P50221 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
MEOX1P50221 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MEOX1P50221 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MEOX1P50221 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MEOX1P50221 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MEOX1P50221 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MEOX1P50221 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MEOX1P50221 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MEOX1P50221 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MEOX1P50221 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MEOX1P50221 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MEOX1P50221 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MEOX1P50221 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MEOX1P50221 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MEOX1P50221 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MEOX1P50221 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MEOX1P50221 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MEOX1P50221 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MEOX1P50221 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MEOX1P50221 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27■■□□□ 1.91
MEOX1P50221 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MEOX1P50221 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MEOX1P50221 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MEOX1P50221 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MEOX1P50221 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MEOX1P50221 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MEOX1P50221 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MEOX1P50221 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MEOX1P50221 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MEOX1P50221 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MEOX1P50221 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MEOX1P50221 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MEOX1P50221 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MEOX1P50221 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MEOX1P50221 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MEOX1P50221 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MEOX1P50221 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MEOX1P50221 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MEOX1P50221 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MEOX1P50221 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MEOX1P50221 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MEOX1P50221 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MEOX1P50221 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MEOX1P50221 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MEOX1P50221 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MEOX1P50221 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
MEOX1P50221 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MEOX1P50221 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MEOX1P50221 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MEOX1P50221 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MEOX1P50221 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MEOX1P50221 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms