Protein–RNA interactions for Protein: P48539

PCP4, Calmodulin regulator protein PCP4, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCP4P48539 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCP4P48539 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCP4P48539 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCP4P48539 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCP4P48539 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCP4P48539 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCP4P48539 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCP4P48539 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCP4P48539 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCP4P48539 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCP4P48539 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCP4P48539 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCP4P48539 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCP4P48539 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCP4P48539 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCP4P48539 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCP4P48539 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCP4P48539 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCP4P48539 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PCP4P48539 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCP4P48539 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PCP4P48539 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCP4P48539 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCP4P48539 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCP4P48539 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCP4P48539 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCP4P48539 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCP4P48539 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCP4P48539 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCP4P48539 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCP4P48539 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCP4P48539 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCP4P48539 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCP4P48539 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCP4P48539 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCP4P48539 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCP4P48539 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PCP4P48539 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCP4P48539 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCP4P48539 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCP4P48539 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCP4P48539 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCP4P48539 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCP4P48539 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCP4P48539 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCP4P48539 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCP4P48539 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCP4P48539 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCP4P48539 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCP4P48539 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCP4P48539 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCP4P48539 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCP4P48539 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCP4P48539 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCP4P48539 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCP4P48539 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCP4P48539 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCP4P48539 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PCP4P48539 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCP4P48539 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCP4P48539 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCP4P48539 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PCP4P48539 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCP4P48539 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCP4P48539 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCP4P48539 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCP4P48539 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCP4P48539 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCP4P48539 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCP4P48539 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCP4P48539 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCP4P48539 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCP4P48539 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PCP4P48539 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PCP4P48539 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PCP4P48539 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PCP4P48539 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PCP4P48539 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PCP4P48539 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PCP4P48539 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PCP4P48539 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PCP4P48539 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PCP4P48539 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PCP4P48539 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCP4P48539 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PCP4P48539 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PCP4P48539 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PCP4P48539 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PCP4P48539 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PCP4P48539 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PCP4P48539 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PCP4P48539 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCP4P48539 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCP4P48539 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PCP4P48539 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PCP4P48539 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PCP4P48539 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PCP4P48539 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PCP4P48539 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PCP4P48539 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms