Protein–RNA interactions for Protein: P42574

CASP3, Caspase-3, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP3P42574 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CASP3P42574 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CASP3P42574 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CASP3P42574 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
CASP3P42574 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CASP3P42574 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CASP3P42574 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CASP3P42574 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CASP3P42574 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CASP3P42574 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CASP3P42574 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CASP3P42574 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CASP3P42574 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CASP3P42574 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CASP3P42574 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CASP3P42574 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CASP3P42574 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CASP3P42574 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CASP3P42574 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CASP3P42574 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CASP3P42574 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CASP3P42574 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CASP3P42574 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CASP3P42574 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CASP3P42574 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CASP3P42574 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CASP3P42574 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CASP3P42574 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CASP3P42574 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CASP3P42574 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CASP3P42574 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CASP3P42574 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CASP3P42574 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CASP3P42574 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CASP3P42574 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CASP3P42574 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CASP3P42574 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CASP3P42574 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CASP3P42574 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CASP3P42574 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CASP3P42574 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CASP3P42574 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CASP3P42574 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CASP3P42574 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CASP3P42574 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CASP3P42574 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CASP3P42574 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CASP3P42574 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CASP3P42574 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CASP3P42574 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CASP3P42574 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CASP3P42574 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CASP3P42574 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CASP3P42574 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CASP3P42574 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CASP3P42574 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CASP3P42574 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CASP3P42574 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CASP3P42574 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CASP3P42574 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CASP3P42574 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CASP3P42574 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CASP3P42574 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CASP3P42574 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CASP3P42574 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CASP3P42574 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CASP3P42574 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CASP3P42574 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CASP3P42574 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CASP3P42574 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CASP3P42574 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CASP3P42574 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CASP3P42574 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CASP3P42574 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CASP3P42574 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CASP3P42574 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CASP3P42574 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CASP3P42574 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CASP3P42574 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CASP3P42574 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CASP3P42574 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CASP3P42574 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CASP3P42574 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CASP3P42574 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CASP3P42574 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CASP3P42574 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CASP3P42574 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CASP3P42574 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CASP3P42574 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CASP3P42574 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CASP3P42574 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CASP3P42574 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CASP3P42574 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CASP3P42574 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CASP3P42574 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CASP3P42574 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CASP3P42574 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CASP3P42574 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CASP3P42574 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CASP3P42574 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms