Protein–RNA interactions for Protein: P38935

IGHMBP2, DNA-binding protein SMUBP-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHMBP2P38935 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC42.85■■■■■ 4.45
IGHMBP2P38935 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC41.88■■■■■ 4.29
IGHMBP2P38935 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
IGHMBP2P38935 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
IGHMBP2P38935 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
IGHMBP2P38935 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.4■■■■■ 4.22
IGHMBP2P38935 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC41.21■■■■■ 4.19
IGHMBP2P38935 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.2■■■■■ 4.19
IGHMBP2P38935 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.21■■■■■ 4.03
IGHMBP2P38935 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
IGHMBP2P38935 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC40.09■■■■■ 4.01
IGHMBP2P38935 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC40.04■■■■■ 4
IGHMBP2P38935 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.01■■■■■ 4
IGHMBP2P38935 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC39.97■■■■□ 3.99
IGHMBP2P38935 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC39.93■■■■□ 3.98
IGHMBP2P38935 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC39.75■■■■□ 3.95
IGHMBP2P38935 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
IGHMBP2P38935 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC39.52■■■■□ 3.92
IGHMBP2P38935 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
IGHMBP2P38935 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
IGHMBP2P38935 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
IGHMBP2P38935 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
IGHMBP2P38935 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
IGHMBP2P38935 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
IGHMBP2P38935 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
IGHMBP2P38935 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC38.8■■■■□ 3.8
IGHMBP2P38935 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
IGHMBP2P38935 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC38.73■■■■□ 3.79
IGHMBP2P38935 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.68■■■■□ 3.78
IGHMBP2P38935 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
IGHMBP2P38935 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
IGHMBP2P38935 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
IGHMBP2P38935 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
IGHMBP2P38935 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
IGHMBP2P38935 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.7
IGHMBP2P38935 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
IGHMBP2P38935 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
IGHMBP2P38935 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
IGHMBP2P38935 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
IGHMBP2P38935 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC38.01■■■■□ 3.68
IGHMBP2P38935 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
IGHMBP2P38935 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
IGHMBP2P38935 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
IGHMBP2P38935 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
IGHMBP2P38935 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
IGHMBP2P38935 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
IGHMBP2P38935 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
IGHMBP2P38935 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
IGHMBP2P38935 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
IGHMBP2P38935 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
IGHMBP2P38935 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC37.41■■■■□ 3.58
IGHMBP2P38935 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
IGHMBP2P38935 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
IGHMBP2P38935 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
IGHMBP2P38935 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
IGHMBP2P38935 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC37.22■■■■□ 3.55
IGHMBP2P38935 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
IGHMBP2P38935 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
IGHMBP2P38935 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
IGHMBP2P38935 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
IGHMBP2P38935 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
IGHMBP2P38935 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
IGHMBP2P38935 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
IGHMBP2P38935 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
IGHMBP2P38935 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC36.93■■■■□ 3.5
IGHMBP2P38935 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC36.92■■■■□ 3.5
IGHMBP2P38935 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
IGHMBP2P38935 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
IGHMBP2P38935 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
IGHMBP2P38935 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
IGHMBP2P38935 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
IGHMBP2P38935 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
IGHMBP2P38935 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC36.73■■■■□ 3.47
IGHMBP2P38935 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
IGHMBP2P38935 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
IGHMBP2P38935 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
IGHMBP2P38935 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
IGHMBP2P38935 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
IGHMBP2P38935 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
IGHMBP2P38935 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
IGHMBP2P38935 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
IGHMBP2P38935 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
IGHMBP2P38935 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
IGHMBP2P38935 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
IGHMBP2P38935 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
IGHMBP2P38935 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
IGHMBP2P38935 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
IGHMBP2P38935 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
IGHMBP2P38935 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
IGHMBP2P38935 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
IGHMBP2P38935 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
IGHMBP2P38935 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
IGHMBP2P38935 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
IGHMBP2P38935 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
IGHMBP2P38935 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
IGHMBP2P38935 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC36.28■■■■□ 3.4
IGHMBP2P38935 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
IGHMBP2P38935 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
IGHMBP2P38935 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
IGHMBP2P38935 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.7 ms