Protein–RNA interactions for Protein: P35398

RORA, Nuclear receptor ROR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORAP35398 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.66■■■□□ 2.82
RORAP35398 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
RORAP35398 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
RORAP35398 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
RORAP35398 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
RORAP35398 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
RORAP35398 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
RORAP35398 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
RORAP35398 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
RORAP35398 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
RORAP35398 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
RORAP35398 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
RORAP35398 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
RORAP35398 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
RORAP35398 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
RORAP35398 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
RORAP35398 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RORAP35398 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
RORAP35398 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
RORAP35398 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RORAP35398 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RORAP35398 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RORAP35398 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RORAP35398 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RORAP35398 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RORAP35398 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RORAP35398 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RORAP35398 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RORAP35398 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RORAP35398 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RORAP35398 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RORAP35398 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RORAP35398 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RORAP35398 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
RORAP35398 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RORAP35398 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RORAP35398 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RORAP35398 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RORAP35398 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29■■■□□ 2.23
RORAP35398 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RORAP35398 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RORAP35398 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
RORAP35398 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RORAP35398 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RORAP35398 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RORAP35398 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RORAP35398 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
RORAP35398 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RORAP35398 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RORAP35398 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RORAP35398 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RORAP35398 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RORAP35398 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RORAP35398 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RORAP35398 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RORAP35398 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RORAP35398 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RORAP35398 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RORAP35398 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RORAP35398 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RORAP35398 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RORAP35398 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RORAP35398 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RORAP35398 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RORAP35398 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RORAP35398 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RORAP35398 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RORAP35398 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RORAP35398 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RORAP35398 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
RORAP35398 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RORAP35398 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RORAP35398 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RORAP35398 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RORAP35398 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RORAP35398 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RORAP35398 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RORAP35398 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RORAP35398 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RORAP35398 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RORAP35398 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RORAP35398 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RORAP35398 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RORAP35398 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RORAP35398 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RORAP35398 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RORAP35398 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RORAP35398 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RORAP35398 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RORAP35398 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RORAP35398 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RORAP35398 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RORAP35398 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RORAP35398 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RORAP35398 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RORAP35398 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
RORAP35398 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RORAP35398 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RORAP35398 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RORAP35398 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms