Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC39.77■■■■□ 3.96
HOXD10P28358 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC39.73■■■■□ 3.95
HOXD10P28358 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.26■■■■□ 3.88
HOXD10P28358 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
HOXD10P28358 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
HOXD10P28358 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
HOXD10P28358 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
HOXD10P28358 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
HOXD10P28358 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC37.92■■■■□ 3.66
HOXD10P28358 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
HOXD10P28358 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
HOXD10P28358 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
HOXD10P28358 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
HOXD10P28358 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
HOXD10P28358 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
HOXD10P28358 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
HOXD10P28358 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
HOXD10P28358 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
HOXD10P28358 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
HOXD10P28358 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
HOXD10P28358 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
HOXD10P28358 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC36.8■■■■□ 3.48
HOXD10P28358 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
HOXD10P28358 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
HOXD10P28358 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
HOXD10P28358 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
HOXD10P28358 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
HOXD10P28358 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
HOXD10P28358 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
HOXD10P28358 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
HOXD10P28358 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
HOXD10P28358 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
HOXD10P28358 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
HOXD10P28358 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
HOXD10P28358 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
HOXD10P28358 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
HOXD10P28358 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
HOXD10P28358 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
HOXD10P28358 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
HOXD10P28358 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
HOXD10P28358 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
HOXD10P28358 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
HOXD10P28358 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
HOXD10P28358 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
HOXD10P28358 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
HOXD10P28358 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
HOXD10P28358 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
HOXD10P28358 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
HOXD10P28358 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
HOXD10P28358 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
HOXD10P28358 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
HOXD10P28358 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
HOXD10P28358 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
HOXD10P28358 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
HOXD10P28358 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
HOXD10P28358 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
HOXD10P28358 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
HOXD10P28358 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
HOXD10P28358 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
HOXD10P28358 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
HOXD10P28358 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
HOXD10P28358 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
HOXD10P28358 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
HOXD10P28358 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
HOXD10P28358 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
HOXD10P28358 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
HOXD10P28358 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
HOXD10P28358 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
HOXD10P28358 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC34.49■■■■□ 3.11
HOXD10P28358 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
HOXD10P28358 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
HOXD10P28358 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
HOXD10P28358 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
HOXD10P28358 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
HOXD10P28358 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
HOXD10P28358 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
HOXD10P28358 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
HOXD10P28358 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
HOXD10P28358 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
HOXD10P28358 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
HOXD10P28358 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
HOXD10P28358 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
HOXD10P28358 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
HOXD10P28358 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
HOXD10P28358 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
HOXD10P28358 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC34.23■■■■□ 3.07
HOXD10P28358 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
HOXD10P28358 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
HOXD10P28358 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
HOXD10P28358 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
HOXD10P28358 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
HOXD10P28358 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
HOXD10P28358 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
HOXD10P28358 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
HOXD10P28358 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
HOXD10P28358 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
HOXD10P28358 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
HOXD10P28358 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
HOXD10P28358 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
HOXD10P28358 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms