Protein–RNA interactions for Protein: P28062

PSMB8, Proteasome subunit beta type-8, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB8P28062 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PSMB8P28062 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSMB8P28062 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSMB8P28062 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PSMB8P28062 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSMB8P28062 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSMB8P28062 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSMB8P28062 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSMB8P28062 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMB8P28062 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMB8P28062 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMB8P28062 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PSMB8P28062 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PSMB8P28062 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSMB8P28062 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSMB8P28062 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSMB8P28062 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSMB8P28062 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMB8P28062 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMB8P28062 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMB8P28062 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMB8P28062 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMB8P28062 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PSMB8P28062 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMB8P28062 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMB8P28062 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMB8P28062 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSMB8P28062 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMB8P28062 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMB8P28062 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMB8P28062 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMB8P28062 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMB8P28062 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMB8P28062 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSMB8P28062 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PSMB8P28062 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSMB8P28062 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSMB8P28062 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSMB8P28062 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMB8P28062 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMB8P28062 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMB8P28062 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMB8P28062 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMB8P28062 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMB8P28062 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMB8P28062 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMB8P28062 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMB8P28062 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMB8P28062 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMB8P28062 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMB8P28062 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMB8P28062 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMB8P28062 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMB8P28062 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMB8P28062 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMB8P28062 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMB8P28062 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMB8P28062 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMB8P28062 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMB8P28062 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMB8P28062 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMB8P28062 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMB8P28062 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PSMB8P28062 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMB8P28062 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMB8P28062 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMB8P28062 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMB8P28062 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PSMB8P28062 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMB8P28062 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMB8P28062 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMB8P28062 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMB8P28062 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMB8P28062 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMB8P28062 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMB8P28062 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMB8P28062 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMB8P28062 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMB8P28062 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMB8P28062 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMB8P28062 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMB8P28062 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMB8P28062 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMB8P28062 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMB8P28062 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PSMB8P28062 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMB8P28062 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMB8P28062 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMB8P28062 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMB8P28062 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMB8P28062 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMB8P28062 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMB8P28062 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMB8P28062 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMB8P28062 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMB8P28062 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PSMB8P28062 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMB8P28062 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMB8P28062 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMB8P28062 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.6 ms