Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC55.72■■■■■ 6.51
PTPRGP23470 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC55.7■■■■■ 6.51
PTPRGP23470 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC55.01■■■■■ 6.4
PTPRGP23470 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.45■■■■■ 6.31
PTPRGP23470 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.82■■■■■ 6.21
PTPRGP23470 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC53.31■■■■■ 6.12
PTPRGP23470 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC53.25■■■■■ 6.11
PTPRGP23470 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC53.13■■■■■ 6.1
PTPRGP23470 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC53.06■■■■■ 6.08
PTPRGP23470 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC52.93■■■■■ 6.06
PTPRGP23470 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.8■■■■■ 6.04
PTPRGP23470 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC52.74■■■■■ 6.03
PTPRGP23470 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC52.71■■■■■ 6.03
PTPRGP23470 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC52.66■■■■■ 6.02
PTPRGP23470 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.6■■■■■ 6.01
PTPRGP23470 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.33■■■■■ 5.97
PTPRGP23470 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC51.88■■■■■ 5.9
PTPRGP23470 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC51.85■■■■■ 5.89
PTPRGP23470 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC51.67■■■■■ 5.86
PTPRGP23470 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC51.56■■■■■ 5.85
PTPRGP23470 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.55■■■■■ 5.84
PTPRGP23470 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC51.55■■■■■ 5.84
PTPRGP23470 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.48■■■■■ 5.83
PTPRGP23470 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC51.46■■■■■ 5.83
PTPRGP23470 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.35■■■■■ 5.81
PTPRGP23470 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.3■■■■■ 5.8
PTPRGP23470 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC51.16■■■■■ 5.78
PTPRGP23470 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.02■■■■■ 5.76
PTPRGP23470 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC50.94■■■■■ 5.74
PTPRGP23470 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC50.87■■■■■ 5.73
PTPRGP23470 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC50.74■■■■■ 5.71
PTPRGP23470 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC50.52■■■■■ 5.68
PTPRGP23470 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.48■■■■■ 5.67
PTPRGP23470 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.46■■■■■ 5.67
PTPRGP23470 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC50.34■■■■■ 5.65
PTPRGP23470 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC50.32■■■■■ 5.65
PTPRGP23470 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC50.17■■■■■ 5.62
PTPRGP23470 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC50.16■■■■■ 5.62
PTPRGP23470 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC49.94■■■■■ 5.58
PTPRGP23470 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.85■■■■■ 5.57
PTPRGP23470 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC49.67■■■■■ 5.54
PTPRGP23470 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC49.51■■■■■ 5.52
PTPRGP23470 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC49.47■■■■■ 5.51
PTPRGP23470 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.41■■■■■ 5.5
PTPRGP23470 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC49.31■■■■■ 5.48
PTPRGP23470 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC49.3■■■■■ 5.48
PTPRGP23470 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49.27■■■■■ 5.48
PTPRGP23470 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.2■■■■■ 5.47
PTPRGP23470 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC49.19■■■■■ 5.47
PTPRGP23470 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC49.19■■■■■ 5.47
PTPRGP23470 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC49.09■■■■■ 5.45
PTPRGP23470 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC49.08■■■■■ 5.45
PTPRGP23470 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC49.07■■■■■ 5.45
PTPRGP23470 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.02■■■■■ 5.44
PTPRGP23470 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC49■■■■■ 5.43
PTPRGP23470 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC48.96■■■■■ 5.43
PTPRGP23470 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC48.96■■■■■ 5.43
PTPRGP23470 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC48.96■■■■■ 5.43
PTPRGP23470 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC48.94■■■■■ 5.43
PTPRGP23470 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.84■■■■■ 5.41
PTPRGP23470 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC48.75■■■■■ 5.4
PTPRGP23470 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC48.66■■■■■ 5.38
PTPRGP23470 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC48.66■■■■■ 5.38
PTPRGP23470 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.65■■■■■ 5.38
PTPRGP23470 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.55■■■■■ 5.36
PTPRGP23470 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC48.51■■■■■ 5.36
PTPRGP23470 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.46■■■■■ 5.35
PTPRGP23470 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC48.43■■■■■ 5.34
PTPRGP23470 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.4■■■■■ 5.34
PTPRGP23470 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC48.37■■■■■ 5.33
PTPRGP23470 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC48.33■■■■■ 5.33
PTPRGP23470 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.33■■■■■ 5.33
PTPRGP23470 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.27■■■■■ 5.32
PTPRGP23470 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.27■■■■■ 5.32
PTPRGP23470 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC48.27■■■■■ 5.32
PTPRGP23470 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.19■■■■■ 5.31
PTPRGP23470 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.18■■■■■ 5.3
PTPRGP23470 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC48.17■■■■■ 5.3
PTPRGP23470 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC48.16■■■■■ 5.3
PTPRGP23470 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.14■■■■■ 5.3
PTPRGP23470 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.06■■■■■ 5.28
PTPRGP23470 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC48.06■■■■■ 5.28
PTPRGP23470 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.05■■■■■ 5.28
PTPRGP23470 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC48.04■■■■■ 5.28
PTPRGP23470 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC47.99■■■■■ 5.27
PTPRGP23470 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.98■■■■■ 5.27
PTPRGP23470 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC47.92■■■■■ 5.26
PTPRGP23470 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC47.91■■■■■ 5.26
PTPRGP23470 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.89■■■■■ 5.26
PTPRGP23470 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC47.88■■■■■ 5.25
PTPRGP23470 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC47.83■■■■■ 5.25
PTPRGP23470 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.8■■■■■ 5.24
PTPRGP23470 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC47.77■■■■■ 5.24
PTPRGP23470 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC47.77■■■■■ 5.24
PTPRGP23470 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.76■■■■■ 5.24
PTPRGP23470 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC47.76■■■■■ 5.24
PTPRGP23470 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC47.75■■■■■ 5.23
PTPRGP23470 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC47.72■■■■■ 5.23
PTPRGP23470 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.72■■■■■ 5.23
PTPRGP23470 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC47.67■■■■■ 5.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms