Protein–RNA interactions for Protein: P22303

ACHE, Acetylcholinesterase, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACHEP22303 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ACHEP22303 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ACHEP22303 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ACHEP22303 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ACHEP22303 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
ACHEP22303 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ACHEP22303 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ACHEP22303 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ACHEP22303 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ACHEP22303 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ACHEP22303 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ACHEP22303 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ACHEP22303 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ACHEP22303 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ACHEP22303 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ACHEP22303 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ACHEP22303 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ACHEP22303 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ACHEP22303 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ACHEP22303 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ACHEP22303 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ACHEP22303 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ACHEP22303 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ACHEP22303 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ACHEP22303 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ACHEP22303 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ACHEP22303 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ACHEP22303 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ACHEP22303 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ACHEP22303 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ACHEP22303 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ACHEP22303 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ACHEP22303 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ACHEP22303 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ACHEP22303 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ACHEP22303 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ACHEP22303 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ACHEP22303 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ACHEP22303 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ACHEP22303 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ACHEP22303 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ACHEP22303 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ACHEP22303 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ACHEP22303 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ACHEP22303 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ACHEP22303 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACHEP22303 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ACHEP22303 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ACHEP22303 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
ACHEP22303 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ACHEP22303 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ACHEP22303 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ACHEP22303 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ACHEP22303 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ACHEP22303 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ACHEP22303 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ACHEP22303 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ACHEP22303 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ACHEP22303 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ACHEP22303 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ACHEP22303 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACHEP22303 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ACHEP22303 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ACHEP22303 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ACHEP22303 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ACHEP22303 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ACHEP22303 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ACHEP22303 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ACHEP22303 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ACHEP22303 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ACHEP22303 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ACHEP22303 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ACHEP22303 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ACHEP22303 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ACHEP22303 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ACHEP22303 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ACHEP22303 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ACHEP22303 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ACHEP22303 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ACHEP22303 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ACHEP22303 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ACHEP22303 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACHEP22303 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ACHEP22303 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ACHEP22303 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ACHEP22303 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ACHEP22303 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ACHEP22303 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ACHEP22303 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ACHEP22303 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACHEP22303 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACHEP22303 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ACHEP22303 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ACHEP22303 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACHEP22303 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACHEP22303 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACHEP22303 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ACHEP22303 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACHEP22303 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACHEP22303 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms