Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC41.3■■■■■ 4.2
SDSP20132 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
SDSP20132 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC40.54■■■■■ 4.08
SDSP20132 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.36■■■■■ 4.05
SDSP20132 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC40.2■■■■■ 4.03
SDSP20132 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.02
SDSP20132 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
SDSP20132 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC39.91■■■■□ 3.98
SDSP20132 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
SDSP20132 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC39.44■■■■□ 3.9
SDSP20132 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
SDSP20132 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC39.29■■■■□ 3.88
SDSP20132 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC39.27■■■■□ 3.88
SDSP20132 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
SDSP20132 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
SDSP20132 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.47■■■■□ 3.75
SDSP20132 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
SDSP20132 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
SDSP20132 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC38.41■■■■□ 3.74
SDSP20132 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
SDSP20132 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.69
SDSP20132 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
SDSP20132 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
SDSP20132 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
SDSP20132 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
SDSP20132 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
SDSP20132 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
SDSP20132 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC37.81■■■■□ 3.64
SDSP20132 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
SDSP20132 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC37.64■■■■□ 3.62
SDSP20132 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
SDSP20132 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
SDSP20132 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
SDSP20132 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
SDSP20132 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
SDSP20132 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC37.45■■■■□ 3.59
SDSP20132 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
SDSP20132 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC37.29■■■■□ 3.56
SDSP20132 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
SDSP20132 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
SDSP20132 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
SDSP20132 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
SDSP20132 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
SDSP20132 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
SDSP20132 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
SDSP20132 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
SDSP20132 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
SDSP20132 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
SDSP20132 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
SDSP20132 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
SDSP20132 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
SDSP20132 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
SDSP20132 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
SDSP20132 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
SDSP20132 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
SDSP20132 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
SDSP20132 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
SDSP20132 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
SDSP20132 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
SDSP20132 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
SDSP20132 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
SDSP20132 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
SDSP20132 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
SDSP20132 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
SDSP20132 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
SDSP20132 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
SDSP20132 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
SDSP20132 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
SDSP20132 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
SDSP20132 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
SDSP20132 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
SDSP20132 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
SDSP20132 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
SDSP20132 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
SDSP20132 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
SDSP20132 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
SDSP20132 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
SDSP20132 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
SDSP20132 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
SDSP20132 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
SDSP20132 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC35.65■■■■□ 3.3
SDSP20132 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
SDSP20132 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
SDSP20132 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
SDSP20132 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
SDSP20132 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
SDSP20132 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
SDSP20132 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
SDSP20132 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
SDSP20132 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
SDSP20132 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
SDSP20132 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
SDSP20132 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
SDSP20132 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC35.36■■■■□ 3.25
SDSP20132 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
SDSP20132 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
SDSP20132 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
SDSP20132 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
SDSP20132 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
SDSP20132 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms