Protein–RNA interactions for Protein: P18084

ITGB5, Integrin beta-5, humanhuman

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB5P18084 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC39.07■■■■□ 3.84
ITGB5P18084 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
ITGB5P18084 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
ITGB5P18084 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC37.86■■■■□ 3.65
ITGB5P18084 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
ITGB5P18084 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
ITGB5P18084 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
ITGB5P18084 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
ITGB5P18084 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
ITGB5P18084 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
ITGB5P18084 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
ITGB5P18084 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
ITGB5P18084 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
ITGB5P18084 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
ITGB5P18084 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
ITGB5P18084 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
ITGB5P18084 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
ITGB5P18084 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
ITGB5P18084 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
ITGB5P18084 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
ITGB5P18084 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
ITGB5P18084 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
ITGB5P18084 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
ITGB5P18084 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
ITGB5P18084 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
ITGB5P18084 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
ITGB5P18084 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
ITGB5P18084 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
ITGB5P18084 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
ITGB5P18084 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
ITGB5P18084 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
ITGB5P18084 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
ITGB5P18084 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
ITGB5P18084 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
ITGB5P18084 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
ITGB5P18084 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
ITGB5P18084 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
ITGB5P18084 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
ITGB5P18084 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
ITGB5P18084 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
ITGB5P18084 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
ITGB5P18084 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
ITGB5P18084 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
ITGB5P18084 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
ITGB5P18084 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
ITGB5P18084 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
ITGB5P18084 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
ITGB5P18084 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
ITGB5P18084 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
ITGB5P18084 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
ITGB5P18084 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.22■■■■□ 3.07
ITGB5P18084 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
ITGB5P18084 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
ITGB5P18084 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
ITGB5P18084 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
ITGB5P18084 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ITGB5P18084 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
ITGB5P18084 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
ITGB5P18084 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
ITGB5P18084 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
ITGB5P18084 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ITGB5P18084 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ITGB5P18084 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ITGB5P18084 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ITGB5P18084 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
ITGB5P18084 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.62■■■□□ 2.97
ITGB5P18084 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ITGB5P18084 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
ITGB5P18084 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
ITGB5P18084 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
ITGB5P18084 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
ITGB5P18084 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
ITGB5P18084 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ITGB5P18084 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ITGB5P18084 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ITGB5P18084 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
ITGB5P18084 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
ITGB5P18084 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
ITGB5P18084 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
ITGB5P18084 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ITGB5P18084 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ITGB5P18084 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
ITGB5P18084 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ITGB5P18084 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
ITGB5P18084 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ITGB5P18084 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
ITGB5P18084 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
ITGB5P18084 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
ITGB5P18084 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
ITGB5P18084 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
ITGB5P18084 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
ITGB5P18084 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ITGB5P18084 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
ITGB5P18084 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
ITGB5P18084 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
ITGB5P18084 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
ITGB5P18084 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
ITGB5P18084 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
ITGB5P18084 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
ITGB5P18084 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms