Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC43.13■■■■■ 4.5
MS4A1P11836 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
MS4A1P11836 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC42.32■■■■■ 4.36
MS4A1P11836 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.15■■■■■ 4.34
MS4A1P11836 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC42.07■■■■■ 4.33
MS4A1P11836 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC41.98■■■■■ 4.31
MS4A1P11836 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC41.85■■■■■ 4.29
MS4A1P11836 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
MS4A1P11836 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
MS4A1P11836 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC41.61■■■■■ 4.25
MS4A1P11836 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC41.22■■■■■ 4.19
MS4A1P11836 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
MS4A1P11836 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC40.92■■■■■ 4.14
MS4A1P11836 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
MS4A1P11836 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
MS4A1P11836 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC40.55■■■■■ 4.08
MS4A1P11836 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
MS4A1P11836 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.41■■■■■ 4.06
MS4A1P11836 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC40.19■■■■■ 4.02
MS4A1P11836 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
MS4A1P11836 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.03■■■■■ 4
MS4A1P11836 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
MS4A1P11836 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.99■■■■□ 3.99
MS4A1P11836 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
MS4A1P11836 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC39.73■■■■□ 3.95
MS4A1P11836 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC39.71■■■■□ 3.95
MS4A1P11836 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.7■■■■□ 3.95
MS4A1P11836 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
MS4A1P11836 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.59■■■■□ 3.93
MS4A1P11836 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
MS4A1P11836 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.52■■■■□ 3.92
MS4A1P11836 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
MS4A1P11836 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
MS4A1P11836 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC39.39■■■■□ 3.9
MS4A1P11836 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
MS4A1P11836 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.88
MS4A1P11836 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
MS4A1P11836 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
MS4A1P11836 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC39.01■■■■□ 3.84
MS4A1P11836 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
MS4A1P11836 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC38.95■■■■□ 3.83
MS4A1P11836 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
MS4A1P11836 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
MS4A1P11836 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
MS4A1P11836 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
MS4A1P11836 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
MS4A1P11836 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
MS4A1P11836 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
MS4A1P11836 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
MS4A1P11836 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
MS4A1P11836 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
MS4A1P11836 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
MS4A1P11836 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
MS4A1P11836 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
MS4A1P11836 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
MS4A1P11836 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
MS4A1P11836 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
MS4A1P11836 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
MS4A1P11836 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
MS4A1P11836 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
MS4A1P11836 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
MS4A1P11836 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
MS4A1P11836 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
MS4A1P11836 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
MS4A1P11836 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC37.87■■■■□ 3.65
MS4A1P11836 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
MS4A1P11836 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
MS4A1P11836 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
MS4A1P11836 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
MS4A1P11836 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
MS4A1P11836 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
MS4A1P11836 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
MS4A1P11836 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
MS4A1P11836 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
MS4A1P11836 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
MS4A1P11836 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
MS4A1P11836 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
MS4A1P11836 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
MS4A1P11836 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
MS4A1P11836 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
MS4A1P11836 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
MS4A1P11836 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
MS4A1P11836 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
MS4A1P11836 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
MS4A1P11836 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC37.27■■■■□ 3.56
MS4A1P11836 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
MS4A1P11836 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
MS4A1P11836 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
MS4A1P11836 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
MS4A1P11836 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
MS4A1P11836 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
MS4A1P11836 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
MS4A1P11836 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
MS4A1P11836 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
MS4A1P11836 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
MS4A1P11836 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC37.02■■■■□ 3.52
MS4A1P11836 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
MS4A1P11836 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
MS4A1P11836 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
MS4A1P11836 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms