Protein–RNA interactions for Protein: P0DP08

IGHV4-38-2, Immunoglobulin heavy variable 4-38-2, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV4-38-2P0DP08 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IGHV4-38-2P0DP08 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
IGHV4-38-2P0DP08 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
IGHV4-38-2P0DP08 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
IGHV4-38-2P0DP08 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IGHV4-38-2P0DP08 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
IGHV4-38-2P0DP08 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
IGHV4-38-2P0DP08 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
IGHV4-38-2P0DP08 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IGHV4-38-2P0DP08 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
IGHV4-38-2P0DP08 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
IGHV4-38-2P0DP08 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
IGHV4-38-2P0DP08 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
IGHV4-38-2P0DP08 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
IGHV4-38-2P0DP08 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
IGHV4-38-2P0DP08 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IGHV4-38-2P0DP08 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
IGHV4-38-2P0DP08 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
IGHV4-38-2P0DP08 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IGHV4-38-2P0DP08 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IGHV4-38-2P0DP08 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IGHV4-38-2P0DP08 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IGHV4-38-2P0DP08 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IGHV4-38-2P0DP08 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IGHV4-38-2P0DP08 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IGHV4-38-2P0DP08 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
IGHV4-38-2P0DP08 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IGHV4-38-2P0DP08 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IGHV4-38-2P0DP08 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IGHV4-38-2P0DP08 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IGHV4-38-2P0DP08 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IGHV4-38-2P0DP08 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IGHV4-38-2P0DP08 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IGHV4-38-2P0DP08 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IGHV4-38-2P0DP08 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
IGHV4-38-2P0DP08 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IGHV4-38-2P0DP08 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IGHV4-38-2P0DP08 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
IGHV4-38-2P0DP08 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IGHV4-38-2P0DP08 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IGHV4-38-2P0DP08 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IGHV4-38-2P0DP08 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IGHV4-38-2P0DP08 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
IGHV4-38-2P0DP08 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IGHV4-38-2P0DP08 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IGHV4-38-2P0DP08 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
IGHV4-38-2P0DP08 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IGHV4-38-2P0DP08 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IGHV4-38-2P0DP08 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IGHV4-38-2P0DP08 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
IGHV4-38-2P0DP08 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
IGHV4-38-2P0DP08 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGHV4-38-2P0DP08 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IGHV4-38-2P0DP08 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IGHV4-38-2P0DP08 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGHV4-38-2P0DP08 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGHV4-38-2P0DP08 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IGHV4-38-2P0DP08 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IGHV4-38-2P0DP08 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IGHV4-38-2P0DP08 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IGHV4-38-2P0DP08 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IGHV4-38-2P0DP08 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IGHV4-38-2P0DP08 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IGHV4-38-2P0DP08 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IGHV4-38-2P0DP08 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IGHV4-38-2P0DP08 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
IGHV4-38-2P0DP08 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGHV4-38-2P0DP08 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IGHV4-38-2P0DP08 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGHV4-38-2P0DP08 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IGHV4-38-2P0DP08 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IGHV4-38-2P0DP08 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IGHV4-38-2P0DP08 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IGHV4-38-2P0DP08 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IGHV4-38-2P0DP08 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IGHV4-38-2P0DP08 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IGHV4-38-2P0DP08 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
IGHV4-38-2P0DP08 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IGHV4-38-2P0DP08 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
IGHV4-38-2P0DP08 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IGHV4-38-2P0DP08 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IGHV4-38-2P0DP08 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IGHV4-38-2P0DP08 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IGHV4-38-2P0DP08 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IGHV4-38-2P0DP08 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IGHV4-38-2P0DP08 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IGHV4-38-2P0DP08 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IGHV4-38-2P0DP08 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IGHV4-38-2P0DP08 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
IGHV4-38-2P0DP08 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IGHV4-38-2P0DP08 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IGHV4-38-2P0DP08 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IGHV4-38-2P0DP08 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IGHV4-38-2P0DP08 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IGHV4-38-2P0DP08 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IGHV4-38-2P0DP08 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IGHV4-38-2P0DP08 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IGHV4-38-2P0DP08 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IGHV4-38-2P0DP08 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IGHV4-38-2P0DP08 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms